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yqs129219

新虫 (小有名气)

[求助] 请问各位前辈们，这样的RNA电泳图能用于RT-PCR吗？

上样量是5ul的RNA和1ul的6Xloding Buffer  前面是DNA Marker2000，颜色淡的浓度是不是很低啊

4列为一个样



4列为一个样
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1楼2012-07-09 17:48:49
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longrna

新虫 (正式写手)
不知道有没有测OD，参考一下OF260/280。点样孔亮可能有杂质（如蛋白）。抽提不干净或转移上清时吸到中间层的蛋白了。下次注意。
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伟大航线....
9楼2012-07-12 08:57:45
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shenye.judy

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
amisking: 金币+3, 鼓励发帖帮助解答问题。 2012-07-09 21:03:10
跑RNA时，还是先测量下OD值，然后加入等量的RNA（0.5-0.75ug），而不是加入等体积的，可比性不好。根据现在的图，看RNA完整度的话，还可以，勉强能用RT-PCR。当然如果做基因表达量比较的话，尽量用质量好的，一致的ＲＮＡ。
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2楼2012-07-09 19:46:29
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yqs129219

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by shenye.judy at 2012-07-09 19:46:29
跑RNA时，还是先测量下OD值，然后加入等量的RNA（0.5-0.75ug），而不是加入等体积的，可比性不好。根据现在的图，看RNA完整度的话，还可以，勉强能用RT-PCR。当然如果做基因表达量比较的话，尽量用质量好的，一致的 ...

测OD值也不一定准确的，根据Marker亮度来大致估算RNA浓度。这样可以吧。我是反转录用来做同源克隆的
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3楼2012-07-09 20:44:15
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shenye.judy

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-07-10 13:45:50
反转录用来做同源克隆，那就没那么严格了，你可以直接往下做试试。
另外，如果你提取的质量较好，且质量较一致的话，跑出来的条带亮度基本是一致的（等量的RNA）。
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4楼2012-07-10 10:40:55
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