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yqs129219

新虫 (小有名气)

[求助] 请问各位前辈们,这样的RNA电泳图能用于RT-PCR吗?

上样量是5ul的RNA和1ul的6Xloding Buffer  前面是DNA Marker2000,颜色淡的浓度是不是很低啊

4列为一个样



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豆豆5273

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+3, 鼓励应助 2012-07-11 13:48:36
我觉得你是上样前未用枪头搅均匀吧,不然,同样的RNA应该是条带亮度一致的啊。。。从亮度来看,可以做反转,分成3管,1管 随机引物,1管特异性引物,1管oligo dT..后面做PCR的引物一定 要好好设计,最好找有经验的人,不同软件分析 后评价都好,再订引物。 一次PCR后上样 如果没条带或者条带浅,就 二次PCR
选择生物并为之努力
5楼2012-07-10 20:32:56
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shenye.judy

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amisking: 金币+3, 鼓励发帖帮助解答问题。 2012-07-09 21:03:10
跑RNA时,还是先测量下OD值,然后加入等量的RNA(0.5-0.75ug),而不是加入等体积的,可比性不好。根据现在的图,看RNA完整度的话,还可以,勉强能用RT-PCR。当然如果做基因表达量比较的话,尽量用质量好的,一致的RNA。
2楼2012-07-09 19:46:29
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yqs129219

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by shenye.judy at 2012-07-09 19:46:29
跑RNA时,还是先测量下OD值,然后加入等量的RNA(0.5-0.75ug),而不是加入等体积的,可比性不好。根据现在的图,看RNA完整度的话,还可以,勉强能用RT-PCR。当然如果做基因表达量比较的话,尽量用质量好的,一致的 ...

测OD值也不一定准确的,根据Marker亮度来大致估算RNA浓度。这样可以吧。我是反转录用来做同源克隆的
3楼2012-07-09 20:44:15
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shenye.judy

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-07-10 13:45:50
反转录用来做同源克隆,那就没那么严格了,你可以直接往下做试试。
另外,如果你提取的质量较好,且质量较一致的话,跑出来的条带亮度基本是一致的(等量的RNA)。
4楼2012-07-10 10:40:55
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