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TA克隆测序之后经过blast比对,中间有一段与数据库中的序列不一样,求教高手啊
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>ref|XM_002371901.1| Toxoplasma gondii ME49 hypothetical protein, mRNA Length=4182 GENE ID: 7895856 TGME49_075470 | hypothetical protein [Toxoplasma gondii ME49] Sort alignments for this subject sequence by: E value Score Percent identity Query start position Subject start position Score = 2717 bits (3012), Expect = 0.0 Identities = 1536/1555 (99%), Gaps = 3/1555 (0%) Strand=Plus/Plus Query 18 ATGGTGACAACAACCACGCCAACGCCTCCACCCGGTGCGCCGGCAGTGGTGCCCATCTTC 77 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 480 ATGGTGACAACAACCACGCCAACGCC---ACCCGGTGCGCCGGCAGTGGTGCCCATCTTC 536 Query 78 GACGTTGTCTATCAACTGAATCCGCACGTGTTTAGAAGTCGCTTTTCCAGGAGGAATCGC 137 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 537 GACGTTGTCTATCAACTGAATCCGCACGTGTTTAGAAGTCGCTTTTCCAGGAGGAATCGC 596 Query 138 GCCAGGCGTGTTGTGAGCAGCAAGTCACGCTCAATAATTCGGTGGCTTGGGTATCTTACG 197 ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 597 GCCAGGCGTGTTGCGAGCAGCAAGTCACGCTCGATAATTCGGTGGCTTGGGTATCTTACG 656 Query 198 GTGCTCGCTGCCGTCATTTTGCTAGGAGCGTATGCAGTAAGGCGTCTATCGCGCGATCTG 257 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| Sbjct 657 GTGCTCGCTGCCGTCATTTTGCTAGGAGCGTATGCAGTAAGGCGTGTATCGCGCGATCTG 716 Query 258 TCCGACTCAGTGCGGGAAACACGGCGAGGCAGGAGAATTACAGGCAGCGTACCTCCCGGG 317 ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 717 TCCGACTCAGTGCGGGAAACACGACGAGGCAGGAGAATTACAGGCAGCGTACCTCCCGGG 776 Query 318 ACTACCCGTCCCCGTTCAGAGTCTTGTACTGGCACACAAGTGGACGGCGGCTGCGGCGCT 377 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 777 ACTACCCGTCCCCGTTCAGAGTCTTGTACTGGCACACAAGTGGACGGCGGCTGCGGCGCT 836 Query 378 GACACGTCAACCGATGGAAAGTCTGAGAGTGAAGAGACCGAAAACGGGGAGGACTCACGC 437 ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| Sbjct 837 GACACGTCAACCGATGGAAAGTCTGAGAGTGAACAGACCGAAAACGGGGAGGACTCACGC 896 Query 438 TTTTCCACCCGGACCCCTATTCATGTTTCTGCATCGACTTCCCCATTCGCGACGCGCAAG 497 |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 897 TTTTCCACCCGGACCCCTATTCATGTCACTGCATCGACTTCCCCATTCGCGACGCGCAAG 956 Query 498 GCGGCGGAAGAACGCTCTTCGAGTCCGAGAGACAGAAAAGTTCCGGAGGGTGCCCAACTC 557 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 957 GCGGCGGAAGAACGCTCTTCGAGTCCGAGAGACAGAAAAGTTCCGGAGGGTGCCCAACTC 1016 Query 558 CCCACGTCGTCGACACCTCATGCACAAAGAAAGGACTCAGGTAGTGATAGCCGGAACCCA 617 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1017 CCCACGTCGTCGACACCTCATGCACAAAGAAAGGACTCAGGTAGTGATAGCCGGAACCCA 1076 Query 618 TCTACACTCATACCTTCACCAGGTACCAACACGTTTAACATGAACTTTTATATTATCGGA 677 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1077 TCTACACTCATACCTTCACCAGGTACCAACACGTTTAACATGAACTTTTATATTATCGGA 1136 Query 678 GCAGGCTCTTCAGCGCTCGATTTTATTTTCCCGCACACTCCGGATGCTCAGGCTACAGTC 737 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1137 GCAGGCTCTTCAGCGCTCGATTTTATTTTCCCGCACACTCCGGATGCTCAGGCTACAGTC 1196 Query 738 GTCTCCCCCCCCCGCAGCGCGGCGGCCGCACCAACTGTCGAAACAGTTCCAAGGGTTCGC 797 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1197 GTCTCCCCCCCCCGCAGCGCGGCGGCCGCACCAACTGTCGAAACAGTTCCAAGGGTTCGC 1256 Query 798 ACTTACTCGACACCAACAACATTAACCCTACCAACGGCACCAGCGACCGCCACTAGCAAC 857 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1257 ACTTACTCGACACCAACAACATTAACCCTACCAACGGCACCAGCGACCGCCACTAGCAAC 1316 Query 858 CACATGCATGCCTCAGCGACTCCCTCGCCACCGGAACGTCCTCAAAACTTCCGTGGGGGA 917 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1317 CACATGCATGCCTCAGCGACTCCCTCGCCACCGGAACGTCCTCAAAACTTCCGTGGGGGA 1376 Query 918 CTCATGCGGCAAAACGGCATGGTTGAGGGGACATCGTTAACAACTACCGAGGCTGGGATG 977 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 1377 CTCATGCGGCAAAACGGCATGGTTGAGGGGACATCGTTAACGACTACCGAGGCTGGGATG 1436 Query 978 CCAGCGCCGTTACAAAGCCCTCAACACATTGAGACGGAGGCGAGGTTAACGTACTCAAAT 1037 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1437 CCAGCGCCGTTACAAAGCCCTCAACACATTGAGACGGAGGCGAGGTTAACGTACTCAAAT 1496 Query 1038 CATCTCAAGAGCCCGCATACACCAGAAACTCCAACTGTCCACTCAATAGACCCCGTTGTC 1097 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1497 CATCTCAAGAGCCCGCATACACCAGAAACTCCAACTGTCCACTCAATAGACCCCGTTGTC 1556 Query 1098 GGCACCAGTGGCCATTCCGTAGCGGTGGGATCGCAGTCTCCAGCTGGTGGACCTCCTACA 1157 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| Sbjct 1557 GGCACCAGTGGCCATTCCGTAGCGGTGGGATCGCAGTCTCCAGCCGGTGGACCTCCTACA 1616 Query 1158 GATAGCCGCACCCCAGCGGCACTGACTCCCACAAGTTCTTCTTTCTCACATGCAGATTCT 1217 |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1617 GATAGCCGCACCCCAGCGGCACTGACCCCCACAAGTTCTTCTTTCTCACATGCAGATTCT 1676 Query 1218 CTTGAAACCTCTGAGCATCCGCAAAGTGGACCGTCGCTTCATCCATTAATCTCTGGGATA 1277 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| Sbjct 1677 CTTGAAACCTCTGAGCATCCGCAAAGTGGACCGTCGCTTCATCCATTAATCTCCGGGATA 1736 Query 1278 CAAGATGCCGTGCAAAGCCAACTTCCACTATCACGACAGGAGACTCTCCCTGTGGTAGAA 1337 |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1737 CAAGATGCCGTGCAAAGCCAACTTCCACTATCACAACAGGAGACTCTCCCTGTGGTAGAA 1796 Query 1338 AATGCGACTTTCTTCGGGCCGCAACAGACTCCACCGTGGATGGACGAAACTGCAGCTGCT 1397 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1797 AATGCGACTTTCTTCGGGCCGCAACAGACTCCACCGTGGATGGACGAAACTGCAGCTGCT 1856 Query 1398 GCAATTCCACTCGCTCCCTCACAACCAGGGTCACGTACACAACCCATCTCGTCTCCGCAT 1457 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1857 GCAATTCCACTCGCTCCCTCACAACCAGGGTCACGTACACAACCCATCTCGTCTCCGCAT 1916 Query 1458 ACTCTACTTCCCCTTAGTGGCGGTGTGTCAGCTGTGCCAGGACCACCCAGAACAGAAAAC 1517 ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1917 ACTCTACTTTCCCGTAGCGGCGGTGTGTCAGCTGTGCCAGGACCACCCAGAACAGAAAAC 1976 Query 1518 CCTCGGCAGCCACAAGTTCCAGGCGAAAACTCTTACTACTCTGTACCAACTGAGC 1572 |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 1977 CCTCGGCAACCACAAGTTCCAGGCGAAAACTCTTACTACTCTGTACCAACTGAGC 2031 Score = 185 bits (204), Expect = 1e-42 Identities = 104/105 (99%), Gaps = 0/105 (0%) Strand=Plus/Plus Query 1822 AGCGGACGATCTCTGATCCAGGTCCCCAAAGGGCGGGTGCGACTCAGGCTGATGGTATCG 1881 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| Sbjct 2029 AGCGGACGATCTCTGATCCAGGTCCCCAAAGGGCGGGTGCGGCTCAGGCTGATGGTATCG 2088 Query 1882 GGGCTGGAGGCCCACGGGACACACAATCAGCGGTAACTCCATGAC 1926 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| Sbjct 2089 GGGCTGGAGGCCCACGGGACACACAATCAGCGGTAACTCCATGAC 2133 |
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