24小时热门版块排行榜    

查看: 1235  |  回复: 0

无踪无影

金虫 (小有名气)

[交流] TA克隆测序之后经过blast比对,中间有一段与数据库中的序列不一样,求教高手啊

>ref|XM_002371901.1|  Toxoplasma gondii ME49 hypothetical protein, mRNA
Length=4182

GENE ID: 7895856 TGME49_075470 | hypothetical protein [Toxoplasma gondii ME49]


                                                         Sort alignments for this subject sequence by:
                                                           E value  Score  Percent identity
                                                           Query start position  Subject start position
Score = 2717 bits (3012),  Expect = 0.0
Identities = 1536/1555 (99%), Gaps = 3/1555 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  18    ATGGTGACAACAACCACGCCAACGCCTCCACCCGGTGCGCCGGCAGTGGTGCCCATCTTC  77
             ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  480   ATGGTGACAACAACCACGCCAACGCC---ACCCGGTGCGCCGGCAGTGGTGCCCATCTTC  536

Query  78    GACGTTGTCTATCAACTGAATCCGCACGTGTTTAGAAGTCGCTTTTCCAGGAGGAATCGC  137
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  537   GACGTTGTCTATCAACTGAATCCGCACGTGTTTAGAAGTCGCTTTTCCAGGAGGAATCGC  596

Query  138   GCCAGGCGTGTTGTGAGCAGCAAGTCACGCTCAATAATTCGGTGGCTTGGGTATCTTACG  197
             ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  597   GCCAGGCGTGTTGCGAGCAGCAAGTCACGCTCGATAATTCGGTGGCTTGGGTATCTTACG  656

Query  198   GTGCTCGCTGCCGTCATTTTGCTAGGAGCGTATGCAGTAAGGCGTCTATCGCGCGATCTG  257
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  657   GTGCTCGCTGCCGTCATTTTGCTAGGAGCGTATGCAGTAAGGCGTGTATCGCGCGATCTG  716

Query  258   TCCGACTCAGTGCGGGAAACACGGCGAGGCAGGAGAATTACAGGCAGCGTACCTCCCGGG  317
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  717   TCCGACTCAGTGCGGGAAACACGACGAGGCAGGAGAATTACAGGCAGCGTACCTCCCGGG  776

Query  318   ACTACCCGTCCCCGTTCAGAGTCTTGTACTGGCACACAAGTGGACGGCGGCTGCGGCGCT  377
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  777   ACTACCCGTCCCCGTTCAGAGTCTTGTACTGGCACACAAGTGGACGGCGGCTGCGGCGCT  836

Query  378   GACACGTCAACCGATGGAAAGTCTGAGAGTGAAGAGACCGAAAACGGGGAGGACTCACGC  437
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  837   GACACGTCAACCGATGGAAAGTCTGAGAGTGAACAGACCGAAAACGGGGAGGACTCACGC  896

Query  438   TTTTCCACCCGGACCCCTATTCATGTTTCTGCATCGACTTCCCCATTCGCGACGCGCAAG  497
             ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  897   TTTTCCACCCGGACCCCTATTCATGTCACTGCATCGACTTCCCCATTCGCGACGCGCAAG  956

Query  498   GCGGCGGAAGAACGCTCTTCGAGTCCGAGAGACAGAAAAGTTCCGGAGGGTGCCCAACTC  557
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  957   GCGGCGGAAGAACGCTCTTCGAGTCCGAGAGACAGAAAAGTTCCGGAGGGTGCCCAACTC  1016

Query  558   CCCACGTCGTCGACACCTCATGCACAAAGAAAGGACTCAGGTAGTGATAGCCGGAACCCA  617
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1017  CCCACGTCGTCGACACCTCATGCACAAAGAAAGGACTCAGGTAGTGATAGCCGGAACCCA  1076

Query  618   TCTACACTCATACCTTCACCAGGTACCAACACGTTTAACATGAACTTTTATATTATCGGA  677
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1077  TCTACACTCATACCTTCACCAGGTACCAACACGTTTAACATGAACTTTTATATTATCGGA  1136

Query  678   GCAGGCTCTTCAGCGCTCGATTTTATTTTCCCGCACACTCCGGATGCTCAGGCTACAGTC  737
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1137  GCAGGCTCTTCAGCGCTCGATTTTATTTTCCCGCACACTCCGGATGCTCAGGCTACAGTC  1196

Query  738   GTCTCCCCCCCCCGCAGCGCGGCGGCCGCACCAACTGTCGAAACAGTTCCAAGGGTTCGC  797
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1197  GTCTCCCCCCCCCGCAGCGCGGCGGCCGCACCAACTGTCGAAACAGTTCCAAGGGTTCGC  1256

Query  798   ACTTACTCGACACCAACAACATTAACCCTACCAACGGCACCAGCGACCGCCACTAGCAAC  857
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1257  ACTTACTCGACACCAACAACATTAACCCTACCAACGGCACCAGCGACCGCCACTAGCAAC  1316

Query  858   CACATGCATGCCTCAGCGACTCCCTCGCCACCGGAACGTCCTCAAAACTTCCGTGGGGGA  917
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1317  CACATGCATGCCTCAGCGACTCCCTCGCCACCGGAACGTCCTCAAAACTTCCGTGGGGGA  1376

Query  918   CTCATGCGGCAAAACGGCATGGTTGAGGGGACATCGTTAACAACTACCGAGGCTGGGATG  977
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  1377  CTCATGCGGCAAAACGGCATGGTTGAGGGGACATCGTTAACGACTACCGAGGCTGGGATG  1436

Query  978   CCAGCGCCGTTACAAAGCCCTCAACACATTGAGACGGAGGCGAGGTTAACGTACTCAAAT  1037
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1437  CCAGCGCCGTTACAAAGCCCTCAACACATTGAGACGGAGGCGAGGTTAACGTACTCAAAT  1496

Query  1038  CATCTCAAGAGCCCGCATACACCAGAAACTCCAACTGTCCACTCAATAGACCCCGTTGTC  1097
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1497  CATCTCAAGAGCCCGCATACACCAGAAACTCCAACTGTCCACTCAATAGACCCCGTTGTC  1556

Query  1098  GGCACCAGTGGCCATTCCGTAGCGGTGGGATCGCAGTCTCCAGCTGGTGGACCTCCTACA  1157
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  1557  GGCACCAGTGGCCATTCCGTAGCGGTGGGATCGCAGTCTCCAGCCGGTGGACCTCCTACA  1616

Query  1158  GATAGCCGCACCCCAGCGGCACTGACTCCCACAAGTTCTTCTTTCTCACATGCAGATTCT  1217
             |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1617  GATAGCCGCACCCCAGCGGCACTGACCCCCACAAGTTCTTCTTTCTCACATGCAGATTCT  1676

Query  1218  CTTGAAACCTCTGAGCATCCGCAAAGTGGACCGTCGCTTCATCCATTAATCTCTGGGATA  1277
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  1677  CTTGAAACCTCTGAGCATCCGCAAAGTGGACCGTCGCTTCATCCATTAATCTCCGGGATA  1736

Query  1278  CAAGATGCCGTGCAAAGCCAACTTCCACTATCACGACAGGAGACTCTCCCTGTGGTAGAA  1337
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1737  CAAGATGCCGTGCAAAGCCAACTTCCACTATCACAACAGGAGACTCTCCCTGTGGTAGAA  1796

Query  1338  AATGCGACTTTCTTCGGGCCGCAACAGACTCCACCGTGGATGGACGAAACTGCAGCTGCT  1397
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1797  AATGCGACTTTCTTCGGGCCGCAACAGACTCCACCGTGGATGGACGAAACTGCAGCTGCT  1856

Query  1398  GCAATTCCACTCGCTCCCTCACAACCAGGGTCACGTACACAACCCATCTCGTCTCCGCAT  1457
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1857  GCAATTCCACTCGCTCCCTCACAACCAGGGTCACGTACACAACCCATCTCGTCTCCGCAT  1916

Query  1458  ACTCTACTTCCCCTTAGTGGCGGTGTGTCAGCTGTGCCAGGACCACCCAGAACAGAAAAC  1517
             ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1917  ACTCTACTTTCCCGTAGCGGCGGTGTGTCAGCTGTGCCAGGACCACCCAGAACAGAAAAC  1976

Query  1518  CCTCGGCAGCCACAAGTTCCAGGCGAAAACTCTTACTACTCTGTACCAACTGAGC  1572
             |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1977  CCTCGGCAACCACAAGTTCCAGGCGAAAACTCTTACTACTCTGTACCAACTGAGC  2031


Score =  185 bits (204),  Expect = 1e-42
Identities = 104/105 (99%), Gaps = 0/105 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1822  AGCGGACGATCTCTGATCCAGGTCCCCAAAGGGCGGGTGCGACTCAGGCTGATGGTATCG  1881
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  2029  AGCGGACGATCTCTGATCCAGGTCCCCAAAGGGCGGGTGCGGCTCAGGCTGATGGTATCG  2088

Query  1882  GGGCTGGAGGCCCACGGGACACACAATCAGCGGTAACTCCATGAC  1926
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2089  GGGCTGGAGGCCCACGGGACACACAATCAGCGGTAACTCCATGAC  2133
回复此楼
一切皆有可能
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

智能机器人

Robot (super robot)

我们都爱小木虫

相关版块跳转 我要订阅楼主 无踪无影 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] FileCode能看出啥? +7 要乐观耀哥 2026-08-10 19/950 2026-08-12 10:55 by 要乐观耀哥
[论文投稿] 职称评审,求友友推荐见刊最快的期刊 +4 工厂打螺丝 2026-08-08 4/200 2026-08-12 09:18 by hansi2025
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +3 majunge000 2026-08-11 4/200 2026-08-11 20:13 by lch2012
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +3 布布和一二 2026-08-11 4/200 2026-08-11 15:20 by aasahr
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +3 majunge000 2026-08-10 3/150 2026-08-10 15:46 by lch2012
[基金申请] 好奇怪的filecode +4 布布和一二 2026-08-08 5/250 2026-08-10 14:20 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +5 布布和一二 2026-08-07 5/250 2026-08-09 16:15 by 袁向阳007
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +5 yang182083 2026-08-06 7/350 2026-08-08 18:29 by zhanghaozhu
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
信息提示
请填处理意见