24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1187  |  回复: 0

无踪无影

金虫 (小有名气)

[交流] TA克隆测序之后经过blast比对,中间有一段与数据库中的序列不一样,求教高手啊

>ref|XM_002371901.1|  Toxoplasma gondii ME49 hypothetical protein, mRNA
Length=4182

GENE ID: 7895856 TGME49_075470 | hypothetical protein [Toxoplasma gondii ME49]


                                                         Sort alignments for this subject sequence by:
                                                           E value  Score  Percent identity
                                                           Query start position  Subject start position
Score = 2717 bits (3012),  Expect = 0.0
Identities = 1536/1555 (99%), Gaps = 3/1555 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  18    ATGGTGACAACAACCACGCCAACGCCTCCACCCGGTGCGCCGGCAGTGGTGCCCATCTTC  77
             ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  480   ATGGTGACAACAACCACGCCAACGCC---ACCCGGTGCGCCGGCAGTGGTGCCCATCTTC  536

Query  78    GACGTTGTCTATCAACTGAATCCGCACGTGTTTAGAAGTCGCTTTTCCAGGAGGAATCGC  137
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  537   GACGTTGTCTATCAACTGAATCCGCACGTGTTTAGAAGTCGCTTTTCCAGGAGGAATCGC  596

Query  138   GCCAGGCGTGTTGTGAGCAGCAAGTCACGCTCAATAATTCGGTGGCTTGGGTATCTTACG  197
             ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  597   GCCAGGCGTGTTGCGAGCAGCAAGTCACGCTCGATAATTCGGTGGCTTGGGTATCTTACG  656

Query  198   GTGCTCGCTGCCGTCATTTTGCTAGGAGCGTATGCAGTAAGGCGTCTATCGCGCGATCTG  257
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct  657   GTGCTCGCTGCCGTCATTTTGCTAGGAGCGTATGCAGTAAGGCGTGTATCGCGCGATCTG  716

Query  258   TCCGACTCAGTGCGGGAAACACGGCGAGGCAGGAGAATTACAGGCAGCGTACCTCCCGGG  317
             ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  717   TCCGACTCAGTGCGGGAAACACGACGAGGCAGGAGAATTACAGGCAGCGTACCTCCCGGG  776

Query  318   ACTACCCGTCCCCGTTCAGAGTCTTGTACTGGCACACAAGTGGACGGCGGCTGCGGCGCT  377
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  777   ACTACCCGTCCCCGTTCAGAGTCTTGTACTGGCACACAAGTGGACGGCGGCTGCGGCGCT  836

Query  378   GACACGTCAACCGATGGAAAGTCTGAGAGTGAAGAGACCGAAAACGGGGAGGACTCACGC  437
             ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  837   GACACGTCAACCGATGGAAAGTCTGAGAGTGAACAGACCGAAAACGGGGAGGACTCACGC  896

Query  438   TTTTCCACCCGGACCCCTATTCATGTTTCTGCATCGACTTCCCCATTCGCGACGCGCAAG  497
             ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  897   TTTTCCACCCGGACCCCTATTCATGTCACTGCATCGACTTCCCCATTCGCGACGCGCAAG  956

Query  498   GCGGCGGAAGAACGCTCTTCGAGTCCGAGAGACAGAAAAGTTCCGGAGGGTGCCCAACTC  557
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  957   GCGGCGGAAGAACGCTCTTCGAGTCCGAGAGACAGAAAAGTTCCGGAGGGTGCCCAACTC  1016

Query  558   CCCACGTCGTCGACACCTCATGCACAAAGAAAGGACTCAGGTAGTGATAGCCGGAACCCA  617
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1017  CCCACGTCGTCGACACCTCATGCACAAAGAAAGGACTCAGGTAGTGATAGCCGGAACCCA  1076

Query  618   TCTACACTCATACCTTCACCAGGTACCAACACGTTTAACATGAACTTTTATATTATCGGA  677
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1077  TCTACACTCATACCTTCACCAGGTACCAACACGTTTAACATGAACTTTTATATTATCGGA  1136

Query  678   GCAGGCTCTTCAGCGCTCGATTTTATTTTCCCGCACACTCCGGATGCTCAGGCTACAGTC  737
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1137  GCAGGCTCTTCAGCGCTCGATTTTATTTTCCCGCACACTCCGGATGCTCAGGCTACAGTC  1196

Query  738   GTCTCCCCCCCCCGCAGCGCGGCGGCCGCACCAACTGTCGAAACAGTTCCAAGGGTTCGC  797
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1197  GTCTCCCCCCCCCGCAGCGCGGCGGCCGCACCAACTGTCGAAACAGTTCCAAGGGTTCGC  1256

Query  798   ACTTACTCGACACCAACAACATTAACCCTACCAACGGCACCAGCGACCGCCACTAGCAAC  857
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1257  ACTTACTCGACACCAACAACATTAACCCTACCAACGGCACCAGCGACCGCCACTAGCAAC  1316

Query  858   CACATGCATGCCTCAGCGACTCCCTCGCCACCGGAACGTCCTCAAAACTTCCGTGGGGGA  917
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1317  CACATGCATGCCTCAGCGACTCCCTCGCCACCGGAACGTCCTCAAAACTTCCGTGGGGGA  1376

Query  918   CTCATGCGGCAAAACGGCATGGTTGAGGGGACATCGTTAACAACTACCGAGGCTGGGATG  977
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  1377  CTCATGCGGCAAAACGGCATGGTTGAGGGGACATCGTTAACGACTACCGAGGCTGGGATG  1436

Query  978   CCAGCGCCGTTACAAAGCCCTCAACACATTGAGACGGAGGCGAGGTTAACGTACTCAAAT  1037
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1437  CCAGCGCCGTTACAAAGCCCTCAACACATTGAGACGGAGGCGAGGTTAACGTACTCAAAT  1496

Query  1038  CATCTCAAGAGCCCGCATACACCAGAAACTCCAACTGTCCACTCAATAGACCCCGTTGTC  1097
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1497  CATCTCAAGAGCCCGCATACACCAGAAACTCCAACTGTCCACTCAATAGACCCCGTTGTC  1556

Query  1098  GGCACCAGTGGCCATTCCGTAGCGGTGGGATCGCAGTCTCCAGCTGGTGGACCTCCTACA  1157
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct  1557  GGCACCAGTGGCCATTCCGTAGCGGTGGGATCGCAGTCTCCAGCCGGTGGACCTCCTACA  1616

Query  1158  GATAGCCGCACCCCAGCGGCACTGACTCCCACAAGTTCTTCTTTCTCACATGCAGATTCT  1217
             |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1617  GATAGCCGCACCCCAGCGGCACTGACCCCCACAAGTTCTTCTTTCTCACATGCAGATTCT  1676

Query  1218  CTTGAAACCTCTGAGCATCCGCAAAGTGGACCGTCGCTTCATCCATTAATCTCTGGGATA  1277
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct  1677  CTTGAAACCTCTGAGCATCCGCAAAGTGGACCGTCGCTTCATCCATTAATCTCCGGGATA  1736

Query  1278  CAAGATGCCGTGCAAAGCCAACTTCCACTATCACGACAGGAGACTCTCCCTGTGGTAGAA  1337
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1737  CAAGATGCCGTGCAAAGCCAACTTCCACTATCACAACAGGAGACTCTCCCTGTGGTAGAA  1796

Query  1338  AATGCGACTTTCTTCGGGCCGCAACAGACTCCACCGTGGATGGACGAAACTGCAGCTGCT  1397
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1797  AATGCGACTTTCTTCGGGCCGCAACAGACTCCACCGTGGATGGACGAAACTGCAGCTGCT  1856

Query  1398  GCAATTCCACTCGCTCCCTCACAACCAGGGTCACGTACACAACCCATCTCGTCTCCGCAT  1457
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1857  GCAATTCCACTCGCTCCCTCACAACCAGGGTCACGTACACAACCCATCTCGTCTCCGCAT  1916

Query  1458  ACTCTACTTCCCCTTAGTGGCGGTGTGTCAGCTGTGCCAGGACCACCCAGAACAGAAAAC  1517
             ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1917  ACTCTACTTTCCCGTAGCGGCGGTGTGTCAGCTGTGCCAGGACCACCCAGAACAGAAAAC  1976

Query  1518  CCTCGGCAGCCACAAGTTCCAGGCGAAAACTCTTACTACTCTGTACCAACTGAGC  1572
             |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  1977  CCTCGGCAACCACAAGTTCCAGGCGAAAACTCTTACTACTCTGTACCAACTGAGC  2031


Score =  185 bits (204),  Expect = 1e-42
Identities = 104/105 (99%), Gaps = 0/105 (0%)
Strand=Plus/Plus

Query  1822  AGCGGACGATCTCTGATCCAGGTCCCCAAAGGGCGGGTGCGACTCAGGCTGATGGTATCG  1881
             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct  2029  AGCGGACGATCTCTGATCCAGGTCCCCAAAGGGCGGGTGCGGCTCAGGCTGATGGTATCG  2088

Query  1882  GGGCTGGAGGCCCACGGGACACACAATCAGCGGTAACTCCATGAC  1926
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  2089  GGGCTGGAGGCCCACGGGACACACAATCAGCGGTAACTCCATGAC  2133
回复此楼
一切皆有可能
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

智能机器人

Robot (super robot)

我们都爱小木虫

相关版块跳转 我要订阅楼主 无踪无影 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿大连理工大学材料求调剂 +6 Gymno 2026-03-30 6/300 2026-03-31 07:26 by 无际的草原
[考研] 求调剂,一志愿 南京航空航天大学 ,080500材料科学与工程学硕,总分289分 +9 @taotao 2026-03-29 9/450 2026-03-30 22:29 by 我是小康
[考研] 085602化工求调剂(331分) +8 111@127 2026-03-30 8/400 2026-03-30 21:23 by 研究僧导导
[考研] 332求调剂 +14 032500 2026-03-25 14/700 2026-03-30 20:03 by 无际的草原
[考研] 297求调剂 +17 田洪有 2026-03-26 18/900 2026-03-30 18:32 by nothing投稿中
[考研] 329求调剂 +8 星野? 2026-03-26 8/400 2026-03-30 13:41 by chemdavid
[考研] 化学308分调剂 +7 你好明天你好 2026-03-30 8/400 2026-03-30 13:02 by 你好明天你好
[考研] 282求调剂 +4 wcq131415 2026-03-24 4/200 2026-03-30 10:39 by Delta2012
[考研] 0856材料化工调剂 总分330 +14 zhubinhao 2026-03-27 14/700 2026-03-29 10:01 by Sjndkwm
[考研] 085600,专业课化工原理,321分求调剂 +5 大馋小子 2026-03-28 5/250 2026-03-29 08:56 by qingfeng258
[考研] 330分求调剂 +5 qzenlc 2026-03-29 5/250 2026-03-29 07:37 by 无际的草原
[考研] 11408软件工程求调剂 +3 Qiu学ing 2026-03-28 3/150 2026-03-28 21:50 by zhq0425
[考研] 311(085601)求调剂 +4 liziyeyeye 2026-03-28 4/200 2026-03-28 18:50 by 535743368
[考研] 药学105500求调剂 +3 Ssun。。 2026-03-28 3/150 2026-03-28 11:24 by lxf170613
[考研] 340求调剂 +5 jhx777 2026-03-27 5/250 2026-03-28 04:18 by fmesaito
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +3 崔wj 2026-03-26 3/150 2026-03-26 19:57 by nihaoar
[考研] 打过很多竞赛,085406控制工程300分,求调剂 +3 askeladz 2026-03-26 3/150 2026-03-26 09:08 by 给你你注意休息
[考研] 290分调剂求助 +3 吉祥止止陈 2026-03-25 3/150 2026-03-25 19:58 by barlinike
[考研] 求调剂 +3 李李不服输 2026-03-25 3/150 2026-03-25 13:03 by cmz0325
[考研] 材料专硕331求调剂 +4 鲜当牛 2026-03-24 4/200 2026-03-24 15:58 by JourneyLucky
信息提示
请填处理意见