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Minnie-zhang

新虫 (初入文坛)

[求助] 双酶切粘性末端连接不上

本人正在超表达载体构建,需要用Pst1和Sal1双酶切质粒2300载体和目的基因,产生相同的粘性末端后连接,但就是连接不上,就高手指教!
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panda73

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+3, 鼓励应助 2012-05-05 13:35:39
有几点建议:
1: 你的载体上PstI和SalI位点之间会切下一个可见的片段吗?
2:如果不能,你需要首先进行两者的单酶切(产生线性化载体片段),然后与未酶切的载体(超螺旋DNA)进行比较,以确定每个酶都在你的质粒上酶切正常。
3:如发现某个单切后与未酶切的质粒电泳特性一样,表明此酶的酶切不正常,可能是质粒上没有这个酶或者此酶失活了,需要再设计实验验证是哪一种情况。
4:如果单切效果良好,表明你的质粒和酶都没问题,那就需要关注酶的用量,加的酶量少回导致酶切不完全,那么克隆是假阳性背景就高,酶量过多,容易出现星活性。我建议你用double digestion designer去计算酶切时所需的酶量,还可以推荐buffer,比较实用,在小木虫上可以搜到的。
6楼2012-05-04 21:32:09
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普通回帖

guishen10

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
载体和目的片段比保持目的片段为载体的五到七倍,过夜连接试试
2楼2012-05-04 16:14:53
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Minnie-zhang

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by guishen10 at 2012-05-04 16:14:53:
载体和目的片段比保持目的片段为载体的五到七倍,过夜连接试试

我已经做过四次了,每次都是过夜连接。前面三次在酶切质粒载体2300时用的是双酶切,没做出来,这一次我用的是单酶切,但是载体回收浓度很低,就是担心啊 !
3楼2012-05-04 16:31:31
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
单酶切难度更哦,尽量用双酶切吧。
Thank-you,so-blue.
4楼2012-05-04 16:42:10
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张宏宇123

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amisking: 金币+2, 鼓励发帖交流问题。 2012-05-04 20:53:27
你载体有没有蓝白筛选?
还有就是你载体有没有突变,或者是目的片段有没有突变,如果有的话导致两端都是同一种粘性末端的话肯定连不上,我以前遇到过这种问题。
载体浓度低无所谓,主要是片段尽可能多一些。
你目的基因是怎么得来的?是pcr直接切的还是在其他质粒上切下来的?
未来不是梦
5楼2012-05-04 20:45:13
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honinglee

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+3, 鼓励应助 2012-05-05 13:35:48
两个建议:1切后回收的片段用65度的去离子水溶最好 不要用试剂盒里自己的EB洗脱,它里有盐,影响连接效率的。
2:不知道2300载体上两个位点隔多远?太近的话容易只单酶切。可以先单酶切后面的那个点,再单切前面的那个点,各一个小时足以;酶切后的大载体用去磷酸酶处理一下,防止自连。同时NEB的这两个酶都有HF的,防止星号活性产生。
天下事有难易乎?为之,则难者亦易矣;不为,则易者亦难矣。
7楼2012-05-05 00:08:45
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mdtdtao

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
换一个酶切体系试试,那个确定酶切体系的网址上,一般会推荐两种酶切体系的。
喜欢一切美好的东西
8楼2012-05-05 10:09:46
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Minnie-zhang

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 张宏宇123 at 2012-05-04 20:45:13:
你载体有没有蓝白筛选?
还有就是你载体有没有突变,或者是目的片段有没有突变,如果有的话导致两端都是同一种粘性末端的话肯定连不上,我以前遇到过这种问题。
载体浓度低无所谓,主要是片段尽可能多一些。
你 ...

我的目的基因是自己克隆,并且已经测序出来的基因,叫ABR1基因。我先把该基因连接到pMD19-T上,在转化到DH5a中保存菌液。要做酶切的时候直接提取后在酶切。至于连接载体,我用的是Pucc2300质粒载体,用Sal1和Pst1酶切。我用双酶切没连接上,上次用单酶切还是没有连接上。我2300质粒载体的浓度不高,是不是这个的问题?
9楼2012-05-07 10:29:21
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Minnie-zhang

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 张宏宇123 at 2012-05-04 20:45:13:
你载体有没有蓝白筛选?
还有就是你载体有没有突变,或者是目的片段有没有突变,如果有的话导致两端都是同一种粘性末端的话肯定连不上,我以前遇到过这种问题。
载体浓度低无所谓,主要是片段尽可能多一些。
你 ...

我的目的基因是自己克隆的,连接到pMD19-T载体上,在转化到DH5a中保存菌液,要用的时候直接提取,再酶切。连接载体我用的是pucc2300载体,前面几次用双酶切,连接不上,上一次先用Sal1酶切再用Pst1单酶切,也没有连接上。我的载体浓度很低,这有没有很大的关系。还有,是不是先用Pst1酶切再用Sal1酶切会不会好些。
10楼2012-05-07 10:34:21
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