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cxnde007

铜虫 (小有名气)

[求助] 构建pBI121表达载体,目的基因与载体连接不上 已有1人参与

连续做了两个多月的表达载体构建了,始终不成功,希望各位大侠给与指点,具体情况如下:
       载体为pBI121,目的基因700bp左右(两端分别加有BamHI 和SacI酶切位点,连接在pmd18-simple上),用这两个酶分别对pBI121和目的基因进行双酶切(先是BamHI 30度 4h,沉淀回收后SacI 37度 4h),电泳检测(酶切完全)并回收,回收后电泳检测条带清晰可见,且大小也是对的。将回收的载体片段与目的基因用连接酶连接(用过宝生物的T4连接酶,现改为NEB的),转化、涂板,来来回回做了不知道多少遍了,现在是在是不知道该怎么办了,哪位做过、遇到过这些问题的大侠帮帮吧,谢谢啦!
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坚强不是我的错
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panda73

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

西瓜(金币+2): 很热心 2012-02-22 18:41:36
我用双酶切软件算了一下你的实验所需的酶量,发现SacI的酶用量应该比BamHI高至少一倍以上。如果你用同样的酶量进行酶切,效果恐怕不太好。
你能确保载体本身处理的很好吗?克隆失败最可能的原因就是载体双酶切不彻底,导致连接反应时载体的自连(载体自连的效率比外源片度插于载体的效率高至少10倍以上)
其实,判断载体处理是否好的一个最可靠的方法就是:设置一个载体的自连接反应,然后转化,看看克隆形成率(与目的连接进行比较),载体处理的好时,目的连接的克隆数较自连的克隆数高3倍以上。
6楼2012-02-21 09:46:36
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panda73

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
小丹木木(金币+1): 鼓励应助 2012-02-21 08:31:02
你克隆不成功的现象是什么?
如果是无克隆:那可能是你的感受态不好用,可以订购新的
如果是无阳性克隆:我建议你做一个空载体的自连对照(即设计一个用水代替700bp片段的平行对照),如果自连对照也长很多克隆,表明你的载体处理有问题。如果自连和目的对照都无克隆,可能是感受态有问题或PCR产物的酶切有问题。
关于分子克隆中的酶切设计,我觉得一个在线软件很好用,能够精确计算双酶切时所需的酶的精确用量(再也不用猜测酶量用得够不够了)还能推荐双酶切的最优buffer,使用很方便,而且现在还可以免费使用,用户名和密码都是test,你可以试一试,相信节省你做克隆的时间
2楼2012-02-20 22:55:32
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panda73

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


西瓜(金币+1): 鼓励热心虫虫 2012-02-22 18:41:00
cxnde007: 金币+1, 有帮助 2012-04-26 09:27:14
双酶切的在线软件,用户名和密码都是test
http://www.bioinfomatics.cn/enzyme/login.php
3楼2012-02-20 22:56:12
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cxnde007

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
: Originally posted by panda73 at 2012-02-20 22:55:32:
你克隆不成功的现象是什么?
如果是无克隆:那可能是你的感受态不好用,可以订购新的
如果是无阳性克隆:我建议你做一个空载体的自连对照(即设计一个用水代替700bp片段的平行对照),如果自连对照也长很多克隆 ...

感受态已经换过了,应该没有问题。
自连也不长菌,我的目的片段是从pmd18-simple上双酶切得到的,而且载体的双酶切也很彻底,我用酶切回收后的载体片段做转化没有菌落,这是不是说明酶切没有问题呢,我以前没做过这方面,实验室的师兄师姐也都没做过,都要愁死了
坚强不是我的错
4楼2012-02-21 08:58:00
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