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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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loveskyzhou

铁虫 (正式写手)


[交流] 合成一段DNA的问题?引物,PCR

想合成一段双链的DNA,大概50个BP,好像公司合的话价格稍高。
想设计成两段引物,想问下如果是两段互补DNA双链的话可以利用一定条件直接使其结合成双链吗?或是设计成两段有重叠的引物,互为模板,是否可行呢?条件大概怎么控制?
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joan198108

铁杆木虫 (正式写手)



loveskyzhou(金币+1):谢谢参与
重叠延伸应该可行吧

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2012-02-11 12:13:55
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wanhscn

木虫 (职业作家)



loveskyzhou(金币+1):谢谢参与
运气好的话,理论上可行!
运气不好,还是得不到你想要的。
3楼2012-02-11 13:08:15
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loveskyzhou

铁虫 (正式写手)


送鲜花一朵
引用回帖:
: Originally posted by joan198108 at 2012-02-11 12:13:55:
重叠延伸应该可行吧

重叠延伸就是两段引物重叠相互P吧,可是这样做的话很难找到合适的Tm值啊,如果重叠过长Tm太高怎么P ? 段的话又怕P不出来。。。。。
4楼2012-02-11 13:29:57
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loveskyzhou(金币+1):谢谢参与
amisking(金币+2): 鼓励发帖交流! 2012-02-11 19:57:01
loveskyzhou(金币+1): 2012-02-13 17:46:40
可以合成两段寡核苷酸单链(加上酶切位点),加上退火缓冲液后从94度降温到退火温度,连到载体上转化大肠杆菌,测序验证,可以引入新的酶切位点等。
5楼2012-02-11 13:33:32
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joan198108

铁杆木虫 (正式写手)


引用回帖:
4楼: Originally posted by loveskyzhou at 2012-02-11 13:29:57:
重叠延伸就是两段引物重叠相互P吧,可是这样做的话很难找到合适的Tm值啊,如果重叠过长Tm太高怎么P ? 段的话又怕P不出来。。。。。

总厂才50bp,我有同学合成过70bp的引物,据说最后目的条带扩增成功,所以重叠可以适当的长一些。关键是PCR后的目的条带比较短,所以电泳分离就比较麻烦,如何保证最终的产物都是延伸完全的,这是个问题。
6楼2012-02-11 13:51:02
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fwks3518

木虫 (正式写手)



loveskyzhou(金币+1):谢谢参与
50bp,比引物长不了多少,那干脆按照引物合成算了,合成正反两条链,一搀和就双链了^_^
7楼2012-02-11 15:19:02
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AnaSequence

金虫 (小有名气)



loveskyzhou(金币+1):谢谢参与
引用回帖:
5楼: Originally posted by blackrose8089 at 2012-02-11 13:33:32:
可以合成两段寡核苷酸单链(加上酶切位点),加上退火缓冲液后从94度降温到退火温度,连到载体上转化大肠杆菌,测序验证,可以引入新的酶切位点等。

有些钱不能省的。至少要像这个专家说的做。小片段最好不要再做延伸了,直接合成两条链变性退火形成酶切位点的,退火后就连接吧。再加入其它对连接而言是杂质的试剂就要纯化,小片段很不好纯化的。
8楼2012-02-11 20:52:48
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lizhaoge

铁虫 (初入文坛)



loveskyzhou(金币+1):谢谢参与
应该可行!PCR条件要跟碱基数目和种类来定,可以在通过软件确定
9楼2012-02-11 22:08:24
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fooooooooox

新虫 (初入文坛)



loveskyzhou(金币+1):谢谢参与
合成两条30nt 单链,中间约10nt互补.加pcr酶,只用一个循环,延伸时间10分钟。要纯的话,可以3%胶回收。一般纯的话,用乙醇沉淀就可以了。
10楼2012-02-12 00:07:19
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loveskyzhou(金币+1):谢谢参与
loveskyzhou(金币+1): 2012-02-13 17:44:50
告诉你公司对这种小片段是怎么合成的:由于你要的DNA只有50bp,他们会先把这两条链分别合成(就当是合了两条50nt的引物,这个对于目前的技术非常容易实现),然后用这两条引物做个退火就OK了。这样得到的双链可以直接用来做连接或者PCR的模板
11楼2012-02-12 09:26:16
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loveskyzhou

铁虫 (正式写手)


引用回帖:
: Originally posted by blackrose8089 at 2012-02-11 13:33:32:
可以合成两段寡核苷酸单链(加上酶切位点),加上退火缓冲液后从94度降温到退火温度,连到载体上转化大肠杆菌,测序验证,可以引入新的酶切位点等。

是马上退到退火温度还是慢慢降温呢?
12楼2012-02-13 17:47:09
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小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
12楼: Originally posted by loveskyzhou at 2012-02-13 17:47:09:
是马上退到退火温度还是慢慢降温呢?

可以用水浴锅,将温度升到94度后,光掉电源,让她慢慢降。。
13楼2012-02-13 18:45:57
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生物一点点

新虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我说啊,就别那么折腾了,现有的基因合成技术很成熟价格也不高,那么点片段500大洋搞定了,何必去搞那些呢,就算你引物设计好啦,合成要50块钱吧,等你拿到货要2-3天时间吧,你摸条件需要消耗20大洋左右吧,结果还没出来一周时间没啦,就算你比较走运p出来的是你的目的条带,你也拿去车测序验证吧,片段太小还不能直接测序那需要做克隆吧200大洋有没啦,测序费需要25吧,合计一下:295,这是比较幸运的有1%的可能。要不成功重头再来一次,那就得花500多大洋啦。时间的损失呢老板可不会心疼你的。所以还直接扔给测序公司。。。。
14楼2012-03-25 19:38:13
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