| 查看: 2961 | 回复: 10 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
【求助】modeller同源建模结果选择
|
|||
|
我利用modeller同源建模，得到了5个结构模型，想请教一下大家，哪个结构更好，还有就是用procheck检验后，是不是还得能量最小化，都用什么软件啊？非常感谢！ >> Summary of successfully produced models: Filename molpdf DOPE score GA341 score ---------------------------------------------------------------------- RhaR.B99990001.pdb 2885.53247 -59417.89063 1.00000 RhaR.B99990002.pdb 2908.28467 -59401.68750 1.00000 RhaR.B99990003.pdb 2893.82813 -59618.50000 1.00000 RhaR.B99990004.pdb 2853.86499 -59416.85938 1.00000 RhaR.B99990005.pdb 2910.96411 -59788.21875 1.00000 |
回复此楼» 猜你喜欢
材料与化工专硕调剂
已经有6人回复
-
086500 325 求调剂
已经有3人回复
-
材料080500调剂求收留
已经有7人回复
-
一志愿南昌大学，327分，材料与化工085600
已经有6人回复
-
环境工程调剂
已经有9人回复
-
工科材料085601 279求调剂
已经有9人回复
-
287求调剂
已经有5人回复
-
22408 344分 求调剂 一志愿 华电计算机技术
已经有3人回复
-
289求调剂
已经有3人回复
-
317求调剂
已经有10人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 求助！蛋白质同源建模，模板不是同工酶，而且相似性低于30%，下一步怎么办？
已经有12人回复
- Gromacs能量最小化问题
已经有5人回复
- 怎样对一个酶进行同源建模，能分析出合理的突变位点
已经有11人回复
- 蛋白质同源模建求助！
已经有6人回复
- Easy modeller 2.0 No module named modeller
已经有5人回复
- autodock对接时蛋白的处理问题
已经有6人回复
- 如何构建重组蛋白的三级结构图
已经有16人回复
- 同源建模时怎样计算一致性和相似性
已经有4人回复
- sybyl与modeller同源模建的区别？
已经有8人回复
- 同源建模之----分别建模
已经有7人回复
- 同源建模需要准备哪些资料
已经有5人回复
- 求助，已有PDB结构的DS同源建模步骤，谢谢
已经有11人回复
- 同源建模，希望建的蛋白质结构，N端和C端分别使用不同的蛋白模版，请教
已经有11人回复
- 请教大家，跨膜蛋白的同源建模，遇到了困难
已经有3人回复
- 关于同源建模预测蛋白三维结构
已经有4人回复
- 同源建模中Anolea是什么意思
已经有8人回复
- 【求助】在swiss model 同源建模以后得到的结果怎么分析
已经有8人回复
- 【求助】求助Easy Modeller 的使用
已经有11人回复
- 【求助】从同源建模开始，一个完整的分子对接实验需要多久？
已经有7人回复
- 【讨论】分子模拟还是同源建模
已经有16人回复
- 【求助】蛋白质建模没有同源模板怎么解决？
已经有11人回复
- 【求助】modeller 的 lisence key ？
已经有7人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
海南大学化工院生物质定向转化课题组招收博士/硕士，2026年9月入学
+1/83
-
有没有在香港的虫友啊
+1/74
-
加拿大阿尔伯塔大学招收电磁、无线通信、机器学习方向全奖硕士/博士/博士后/访问学者
+1/53
-
招收荧光探针/有机合成/生物学 博士后--薪金: 30万-50万
+1/37
-
0854电子信息调剂，闽南师大光电芯片研发实验室
+1/35
-
福建师范大学闽江学者陈巍教授团队招收2026年化学、化工或材料专业的学硕6名
+1/35
-
上海交通大学沈道智副教授招收2026年联培博士/硕士研究生（微纳器件与制造方向）
+1/33
-
中山大学院士团队微纳器件、脑机接口方向博士招生、博后招聘
+1/18
-
南开大学陈树琪教授研究团队招收2026级超构材料方向博士研究生
+1/12
-
【科研干货】纳米抗体凭什么成为实验室“新宠”？附优质制备服务商参考
+1/7
-
青岛科技大学可持续高分子团队 考研招生
+1/6
-
26年申博自荐-计算机视觉
+1/6
-
欢迎生物与医药、药学、化学等相关专业的同学
+1/5
-
211/双一流石河子大学化学化工学院--电催化，CO2转化
+1/4
-
中科院上海微系统所材料生长理论与仿真课题组-博士后招聘（材料计算与AI4S）
+1/3
-
求调剂｜一志愿广东工业大学控制工程｜总分355｜本科电气｜有项目/竞赛/论文经历
+1/3
-
Top-88悉尼科技大学数据科学/AI 招收2027年入学 校奖 博士生1到2名(国际和本地学生）
+1/2
-
武汉纺织大学杰青团队招研究生（材料，化学，高分子，化工）
+1/2
-
欢迎加入赣南师范大学先进光电子研究中心
+1/2
-
【2026年春季补录】厦门大学田中群院士/易骏教授纳米光子学团队招收2026年入学博士生
+1/1
4楼2011-01-08 22:25:00
★ ★ ★
ghcacj(金币+3):谢谢 2011-01-08 14:36:53
tq-liu(金币+1): 2011-01-08 22:17:36
tq-liu(金币+1): 2011-01-10 16:33:47
ghcacj(金币+3):谢谢 2011-01-08 14:36:53
tq-liu(金币+1): 2011-01-08 22:17:36
tq-liu(金币+1): 2011-01-10 16:33:47
|
[quote]Originally posted by tq-liu at 2011-01-07 18:13:26: 我利用modeller同源建模，得到了5个结构模型，想请教一下大家，哪个结构更好，还有就是用procheck检验后，是不是还得能量最小化，都用什么软件啊？非常感谢！ 没有任何一种评分标准时完全可靠的，不过有一些经验上的规则，一个好的模型GA341会接近1，越大越好，DOPE和MOLPDF越小越好，如果GA341小于0.6都是不好的模型。 能量最小化可以尝试分子动力学软件，比如GROMACS,NAMD等等 |
2楼2011-01-08 09:23:00
3楼2011-01-08 22:22:47
5楼2011-01-10 16:34:16
