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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】modeller同源建模结果选择
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tq-liu

金虫 (著名写手)

[交流] 【求助】modeller同源建模结果选择

我利用modeller同源建模，得到了5个结构模型，想请教一下大家，哪个结构更好，还有就是用procheck检验后，是不是还得能量最小化，都用什么软件啊？非常感谢！

>> Summary of successfully produced models:
Filename                          molpdf     DOPE score    GA341 score
----------------------------------------------------------------------
RhaR.B99990001.pdb            2885.53247   -59417.89063        1.00000
RhaR.B99990002.pdb            2908.28467   -59401.68750        1.00000
RhaR.B99990003.pdb            2893.82813   -59618.50000        1.00000
RhaR.B99990004.pdb            2853.86499   -59416.85938        1.00000
RhaR.B99990005.pdb            2910.96411   -59788.21875        1.00000
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1楼 2011-01-07 18:13:26
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tq-liu

金虫 (著名写手)
照你这么分析的话，我的这个模型结构还可以，我可以直接进行分子对接吗？我有篇文章前期实验数据都很完全，只是后面想加点结构上的分析，但是又不想再跑md了，直接用对接结果分析，能行不？
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3楼2011-01-08 22:22:47
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tq-liu

金虫 (著名写手)
非常感谢，楼主好人啊
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5楼2011-01-10 16:34:16
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