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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 如何构建重组蛋白的三级结构图
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小小赵5881

金虫 (初入文坛)

[求助] 如何构建重组蛋白的三级结构图

我用swiss model进行蛋白质空间结构预测，但是得到的结果只是蛋白质中某个片段序列的结构，通过什么方法才能获得重组蛋白质全长序列的三级结构图
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1楼 2013-04-25 11:38:16
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

凌波丽

专家顾问 (知名作家)

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★
小小赵5881: 金币+1 2013-05-06 12:15:31
楼主问的是蛋白质的三维结构预测。

基本原理与基本操作请看附件：
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  • 附件 1 : 蛋白质结构预测原理概述.pdf
    • 2013-05-05 18:24:38, 138.96 K
3楼2013-05-05 18:17:25
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
小小赵5881: 金币+2 2013-05-06 12:17:23
小小赵5881(gyesang代发): 金币+2, 鼓励回帖应助！ 2013-05-06 12:23:52
内容已删除
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4楼2013-05-05 18:18:11
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
小小赵5881: 金币+2 2013-05-20 20:30:26
小丹木木: 金币+2, 神级的丽美眉，出山了 2013-05-21 10:57:15
http://www.predictprotein.org/

http://smart.embl-heidelberg.de/

http://bmerc-www.bu.edu/psa/

http://mobyle.pasteur.fr/cgi-bin/portal.py?#forms::toppred
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8楼2013-05-06 12:30:50
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xulinan

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
小小赵5881(小丹木木代发): 金币+3, 鼓励热心的虫虫交流经验 2013-05-21 10:57:42
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9楼2013-05-06 12:44:53
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lwroche

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助！ 2013-05-05 17:34:14
小小赵5881: 金币+1, ★有帮助 2013-05-06 12:15:15
我觉得通过生物信息学-swiss model进行蛋白质空间结构预测，只能从已有的数据库中搜索相似性结构，如果数据库中没有你的重组蛋白序列，得到的结果当然是蛋白质中某个片段序列的结构。
所以，通过要通过蛋白纯化，然后结晶，采用结构生物学方法获得3级结构，如X射线，核磁共振的方法获得重组蛋白质全长序列的三级结构图
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2楼2013-05-05 17:17:03
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小小赵5881

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lwroche at 2013-05-05 17:17:03
我觉得通过生物信息学-swiss model进行蛋白质空间结构预测，只能从已有的数据库中搜索相似性结构，如果数据库中没有你的重组蛋白序列，得到的结果当然是蛋白质中某个片段序列的结构。
所以，通过要通过蛋白纯化，然 ...

感谢回复，但是我就是想在结晶之前，通过网站或软件先预测一下，因为纯化和结晶需要时间且还要花钱，我的重组蛋白是用来作疫苗的，空间结构很重要，我想事先知道它的结构好从一堆氨基酸序列中选出最优的
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5楼2013-05-06 12:14:47
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小小赵5881

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 凌波丽 at 2013-05-05 18:17:25
楼主问的是蛋白质的三维结构预测。

基本原理与基本操作请看附件：

此文献之前看过，但还是感谢
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6楼2013-05-06 12:15:23
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小小赵5881

金虫 (初入文坛)
内容已删除
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7楼2013-05-06 12:17:04
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
小小赵5881: 金币+2 2013-05-20 20:32:02
小小赵5881: 金币+3, ★有帮助, 不太能满足我的需要，至少您费心了，多谢。 2019-04-23 11:16:47
如果针对抗原决定簇的三维接预测也可以用BioEdit和DNAStar，论坛里有软件免费下载和使用说明。
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10楼2013-05-06 13:09:56
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