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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 如何构建重组蛋白的三级结构图
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

modeller是现在比较流行的同源建模软件，下载：http://salilab.org/modeller

SWISS-MODEL也是现在比较流行的同源建模软件，下载：http://swissmodel.expasy.org

楼主可以自行选择。
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11楼2013-05-06 13:35:32
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小小赵5881

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
9楼: Originally posted by xulinan at 2013-05-06 12:44:53
建议用modeller试试，swiss建模的效果不好，做简单的点突变还可以。如果楼主同学有用DS的最好，DS比较容易上手，但是DS是收费的，如果没有版权建议就用modeller吧。DS的建模核心其实就是modeller，只是DS操作方式简 ...

请问DS的全称是什么
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12楼2013-05-20 08:22:43
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小小赵5881

金虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 凌波丽 at 2013-05-06 12:30:50
http://www.predictprotein.org/

http://smart.embl-heidelberg.de/

http://bmerc-www.bu.edu/psa/

http://mobyle.pasteur.fr/cgi-bin/portal.py?#forms::toppred...

非常感谢，但前三个只能预测二级结构，后一个是预测跨膜蛋白的拓扑结构的，都不能满足我的要求
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13楼2013-05-20 20:30:02
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小小赵5881

金虫 (初入文坛)
内容已删除
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14楼2013-05-20 20:33:24
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547star

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

把序列告诉我,我查看看有没有现成预测好的.
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为什么
15楼2013-05-21 09:02:21
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
14楼: Originally posted by 小小赵5881 at 2013-05-20 20:33:24
，亲，你真是古道热肠，但是这两个软件不能告诉我，抗原决定簇是否在蛋白质的表面...

你是说要抗原表位预测？
KABAT数据库：http://immuno.bme.nwu.edu/

EpitopePrediction:
http://www.syfpeithi.de/Scripts/ ... itopePrediction.htm

http://www.doc88.com/p-804578924227.html

http://blog.sina.com.cn/s/blog_66b58ec80100r3vt.html
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16楼2013-05-26 16:49:47
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

http://www.epitope-informatics.com/Links.htm
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17楼2013-05-26 16:50:48
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