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小小赵5881

金虫 (初入文坛)

[求助] 如何构建重组蛋白的三级结构图

我用swiss model进行蛋白质空间结构预测,但是得到的结果只是蛋白质中某个片段序列的结构,通过什么方法才能获得重组蛋白质全长序列的三级结构图
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凌波丽

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小小赵5881: 金币+1 2013-05-06 12:15:31
楼主问的是蛋白质的三维结构预测。

基本原理与基本操作请看附件:

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  • 附件 1 : 蛋白质结构预测原理概述.pdf
  • 2013-05-05 18:24:38, 138.96 K
3楼2013-05-05 18:17:25
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凌波丽

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
小小赵5881: 金币+2 2013-05-06 12:17:23
小小赵5881(gyesang代发): 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-05-06 12:23:52
内容已删除
4楼2013-05-05 18:18:11
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凌波丽

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★ ★ ★ ★
小小赵5881: 金币+2 2013-05-20 20:30:26
小丹木木: 金币+2, 神级的丽美眉,出山了 2013-05-21 10:57:15
8楼2013-05-06 12:30:50
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xulinan

木虫 (小有名气)

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★ ★ ★
小小赵5881(小丹木木代发): 金币+3, 鼓励热心的虫虫交流经验 2013-05-21 10:57:42
内容已删除
9楼2013-05-06 12:44:53
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lwroche

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-05-05 17:34:14
小小赵5881: 金币+1, 有帮助 2013-05-06 12:15:15
我觉得通过生物信息学-swiss model进行蛋白质空间结构预测,只能从已有的数据库中搜索相似性结构,如果数据库中没有你的重组蛋白序列,得到的结果当然是蛋白质中某个片段序列的结构。
所以,通过要通过蛋白纯化,然后结晶,采用结构生物学方法获得3级结构,如X射线,核磁共振的方法获得重组蛋白质全长序列的三级结构图
2楼2013-05-05 17:17:03
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小小赵5881

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lwroche at 2013-05-05 17:17:03
我觉得通过生物信息学-swiss model进行蛋白质空间结构预测,只能从已有的数据库中搜索相似性结构,如果数据库中没有你的重组蛋白序列,得到的结果当然是蛋白质中某个片段序列的结构。
所以,通过要通过蛋白纯化,然 ...

感谢回复,但是我就是想在结晶之前,通过网站或软件先预测一下,因为纯化和结晶需要时间且还要花钱,我的重组蛋白是用来作疫苗的,空间结构很重要,我想事先知道它的结构好从一堆氨基酸序列中选出最优的
5楼2013-05-06 12:14:47
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小小赵5881

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 凌波丽 at 2013-05-05 18:17:25
楼主问的是蛋白质的三维结构预测。

基本原理与基本操作请看附件:

此文献之前看过,但还是感谢
6楼2013-05-06 12:15:23
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小小赵5881

金虫 (初入文坛)

内容已删除
7楼2013-05-06 12:17:04
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凌波丽

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★ ★ ★ ★ ★
小小赵5881: 金币+2 2013-05-20 20:32:02
小小赵5881: 金币+3, 有帮助, 不太能满足我的需要,至少您费心了,多谢。 2019-04-23 11:16:47
如果针对抗原决定簇的三维接预测也可以用BioEdit和DNAStar,论坛里有软件免费下载和使用说明。
10楼2013-05-06 13:09:56
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