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houchenxi

金虫 (初入文坛)

[求助] pcr电泳条带弥散

想要p出一个4kb的目的基因,一直p不出来,请大神帮帮忙

我用的cDNA是从RPE细胞内提取出来的,用的聚合酶是方塔高保真酶
体系如下(单位:微升):
灭菌miniQ:2.8
模板cDNA:2
5*enhancer:2
5*SFbuffer:2
引物1:  0.4
引物2:  0.4
dNTPmix:0.2
方塔高保真酶:0.2

其中引物都稀释到10vm,

温度设置:
预变性 95度  2min
变性     95度   10s
退火     50~69 都试过  20s
延伸     72度    2min
彻底延伸  72度   10min
中间三个步骤30个cycle

跑胶结果是弥散的(图一):

为了证明我的体系是没错的,我用师兄的引物,其他都用我自己的做了一次,发现是能够p出来的(图二)

之后为了证明引物没有降解,我使用琼脂糖凝胶电泳(1%,加4微升EB),引物:10*loading buffer:dd水=2:1:7.跑了10分钟,marker右边两个是现在在用的引物(图三)。

引物已经重新设计过一遍了,连接片段和文献上的相同,
其实刚开始还是有非特异性条带的(图四),现在连非特异性的都没了,实在不知道为什么

请大神们指教

pcr电泳条带弥散
图一.jpg


pcr电泳条带弥散-1
图二.jpg


pcr电泳条带弥散-2
图三.jpg


pcr电泳条带弥散-3
图四.jpg
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以诚感人者,人亦诚以应。
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houchenxi

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 痕毋量 at 2017-03-30 23:26:37
延伸时间是不是太短了  1kb大小大约1min

我之前用过3min的延伸时间,也没p出来,我试一下4min的

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以诚感人者,人亦诚以应。
3楼2017-03-31 09:20:48
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痕毋量

新虫 (初入文坛)

延伸时间是不是太短了  1kb大小大约1min

发自小木虫Android客户端
2楼2017-03-30 23:26:37
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houchenxi

金虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 痕毋量 at 2017-03-30 23:26:37
延伸时间是不是太短了  1kb大小大约1min

不行啊,还是没有条带,我怀疑是不是引物和模板的问题,毕竟之前还是能配p出来的

发自小木虫Android客户端
以诚感人者,人亦诚以应。
4楼2017-04-07 10:49:11
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