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饿的神啊

新虫 (著名写手)

[求助] 酶切连接不成功 已有1人参与

我想构建一个发夹结构用于RNAi,把长片段插入T载体(下游引物上有ClaI酶切位点),然后通过XhoI和ClaI双酶切短片段(上游引物加了XhoI,下游引物加ClaI)和长片段质粒,NEB的内切酶,酶切了一个小时,然后胶回收,用的promega T4连接酶连接,室温2h,然后转化,可是筛选出来的都只有长片段,没有短片段,说明连接没成功,是哪里的问题呢?
发夹结构是不是长片段用正向,短片段用反向插入的,不然接头对不上啊,但是没有成功?我怕自己搞错了方向,后来没有把短片段连T载体,直接把PCR产物胶回收后双酶切了,还是没有成功。我又把筛选的反向插入的长片段作为模板,扩增短片段,然后把PCR产物双酶切,可是还是不成功,到底是为什么啊

@youlinglyw @biostar2009 发自小木虫Android客户端
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董红红

铜虫 (小有名气)

楼主,你好,我最近构建表达载体,也用到了和你的差不多的技术,我可以请教你一下吗?酶切之后连接完了不可以直接PCR验证吗?为什么还要做转化呢?是不是因为连接后的反应液太少,然后转化扩繁要增大量呢?

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5楼2016-10-22 21:59:59
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普通回帖

饿的神啊

新虫 (著名写手)

2楼2016-10-13 11:32:25
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star013

新虫 (知名作家)


我们公司可以做载体构建技术服务

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3楼2016-10-13 12:00:53
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bio转录组

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-10-13 22:47:51
饿的神啊: 金币+20, 有帮助 2016-10-18 13:00:08
连接时间有点短吧,我们这T4连接的话都是过夜,你可以延长连接时间试一下。16°
生活活生生累死
4楼2016-10-13 21:44:22
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MAS_rice

至尊木虫 (著名写手)

我也是,跟你一样的,我用的是双切双连,正向插入片段连上了,反向插入片段死活连不上。

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竹杖芒鞋轻胜马,谁怕,一蓑烟雨任平生;回首向来萧瑟处,归去,也无风雨也无晴
6楼2016-10-30 23:17:53
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choujiaoqi

铁杆木虫 (知名作家)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 董红红 at 2016-10-22 21:59:59
楼主,你好,我最近构建表达载体,也用到了和你的差不多的技术,我可以请教你一下吗?酶切之后连接完了不可以直接PCR验证吗?为什么还要做转化呢?是不是因为连接后的反应液太少,然后转化扩繁要增大量呢?
...

连接有顺反之分,还有很多非特异连接。要用载体就是为了获得大量纯净的片段。也可以为了下一步研究做准备。常见有克隆载体和表达载体

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7楼2016-10-31 00:17:27
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董红红

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by choujiaoqi at 2016-10-31 00:17:27
连接有顺反之分,还有很多非特异连接。要用载体就是为了获得大量纯净的片段。也可以为了下一步研究做准备。常见有克隆载体和表达载体
...

谢谢你的解答,我还有个问题,因为我把目的片段插入载体之后是要通过PEG介导的原生质体转化法进行下一步实验,而这一步需要线性化得DNA片段,那我把我构建的表达载体单酶切线性化后还会影响表达载体的表达吗?谢谢

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8楼2016-10-31 08:57:55
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choujiaoqi

铁杆木虫 (知名作家)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 董红红 at 2016-10-31 08:57:55
谢谢你的解答,我还有个问题,因为我把目的片段插入载体之后是要通过PEG介导的原生质体转化法进行下一步实验,而这一步需要线性化得DNA片段,那我把我构建的表达载体单酶切线性化后还会影响表达载体的表达吗?谢谢
...

如果你需要把载体转染到细胞表达的话,就需要成环的质粒,只有在超螺旋状态才能进去透过细胞,线性片段就很难通过细胞膜。所以不需要切开。当然你的下有研究我不是很清楚

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9楼2016-10-31 11:54:39
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董红红

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by choujiaoqi at 2016-10-31 11:54:39
如果你需要把载体转染到细胞表达的话,就需要成环的质粒,只有在超螺旋状态才能进去透过细胞,线性片段就很难通过细胞膜。所以不需要切开。当然你的下有研究我不是很清楚
...

嗯嗯,好的,谢谢你

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10楼2016-10-31 15:07:00
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