各位大神，小弟最近接触蛋白质小分子相互作用分析，想请教一下用什么方法可以测定蛋白质和小分子如何共价结合？ 返回小木虫查看更多
共价结合？变性胶电泳看条带迁移，或者一级质谱，可以证明共价结合了。二级质谱可以分析结合位点。
理论上不会，但实际上是有一定可能性的，取决于结合强度。比如streptavidin和biotin的结合，sds-Page也分不开。
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共价结合？变性胶电泳看条带迁移，或者一级质谱，可以证明共价结合了。二级质谱可以分析结合位点。
您好，目前我可以确认是共价结合，我现在想要探究到底结合位点是什么，您讲的二级质谱是？哪里可以测试？
二级质谱就是将蛋白酶切之后鉴定肽段序列，第一级看肽段总分子量，二级看该肽段断裂之后的碎片，从而鉴定出小分子修饰的位置、理想情况下可以看出具体修饰在哪个氨基酸上面。
我是用系里自己的质谱，不对外。您可以看看您所在机构有没有相应的仪器。
好的，谢谢指点。另外，想请教一下您如果小分子和蛋白质是非共价结合，是否能在结合后跑SDS胶，最终还能在目标蛋白胶条中找到小分子
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理论上不会，但实际上是有一定可能性的，取决于结合强度。比如streptavidin和biotin的结合，sds-Page也分不开。