如题,发现一个转录因子,想钓一下下游互作的蛋白,但是看文章有的转录因子做双杂有的做单杂,所以请教一下各位大佬,到底做哪一种么呢 (这个转录因子调控BTB蛋白,与细胞分裂有关,但不知道与下游什么蛋白互作) 返回小木虫查看更多
单杂
我觉得可以去送公司建库,回来做双杂筛选
双杂是蛋白-蛋白互作;单杂是DNA-蛋白互作。
单杂是蛋白与DNA互作,如果你是想知道你的转录因子调控哪个基因的表达,那么做单杂可以找出下游和转录因子结合的启动子序列,再到基因组里面local blast一下,就能知道下游调控的蛋白是什么了。 双杂是蛋白与蛋白互作,如果你想知道你的转录因子是不是会和什么别的蛋白相互结合,起什么别的作用,那么你就需要做双杂找到这个直接和你的转录因子互作的蛋白。 我最近也在筛库,不对之处还请各位大佬批评指正,
双杂。
单杂
我觉得可以去送公司建库,回来做双杂筛选
双杂是蛋白-蛋白互作;单杂是DNA-蛋白互作。
单杂是蛋白与DNA互作,如果你是想知道你的转录因子调控哪个基因的表达,那么做单杂可以找出下游和转录因子结合的启动子序列,再到基因组里面local blast一下,就能知道下游调控的蛋白是什么了。
双杂是蛋白与蛋白互作,如果你想知道你的转录因子是不是会和什么别的蛋白相互结合,起什么别的作用,那么你就需要做双杂找到这个直接和你的转录因子互作的蛋白。
我最近也在筛库,不对之处还请各位大佬批评指正,
双杂。