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分子对接,在pymol中形成pdb复合物后,查看相互作用力问题(氢键)

作者 Yongqi琦
来源: 小木虫 250 5 举报帖子
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使用Autodock vina做完对接后,导入pymol软件查看配体与蛋白的氢键作用,按照教程说的find-polar contacts-to other atoms in objects,却没有显示除氢键。但是直接导入原配体蛋白又可以显示氢键关系,请问有人知道如何处理该问题么?我在对接前处理蛋白,加的是全氢,不是极性氢,有关系么? 返回小木虫查看更多

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  • 精华评论
  • longytu

    首先确定后对接后一定有氢键吗?一些化合物不容易成氢键

  • Yongqi琦

    引用回帖:
    2楼: Originally posted by longytu at 2020-05-05 09:15:52
    首先确定后对接后一定有氢键吗?一些化合物不容易成氢键

    嗯额,知道了,谢谢

  • wuli.小月

    引用回帖:
    2楼: Originally posted by longytu at 2020-05-05 09:15:52
    首先确定后对接后一定有氢键吗?一些化合物不容易成氢键

    楼主能不能分享一下下pymol和autodock软件呀呀呀

  • ustblh

    引用回帖:
    5楼: Originally posted by wuli.小月 at 2020-05-27 18:58:36
    楼主能不能分享一下下pymol和autodock软件呀呀呀...

    加我q2337623208

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