24小时热门版块排行榜    

查看: 3747  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

Yongqi琦

铁虫 (初入文坛)

[求助] 分子对接,在pymol中形成pdb复合物后,查看相互作用力问题(氢键)

使用Autodock vina做完对接后,导入pymol软件查看配体与蛋白的氢键作用,按照教程说的find-polar contacts-to other atoms in objects,却没有显示除氢键。但是直接导入原配体蛋白又可以显示氢键关系,请问有人知道如何处理该问题么?我在对接前处理蛋白,加的是全氢,不是极性氢,有关系么?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wuli.小月

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by longytu at 2020-05-05 09:15:52
首先确定后对接后一定有氢键吗?一些化合物不容易成氢键

楼主能不能分享一下下pymol和autodock软件呀呀呀
5楼2020-05-27 18:58:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

longytu

捐助贵宾 (正式写手)


首先确定后对接后一定有氢键吗?一些化合物不容易成氢键

发自小木虫IOS客户端
2楼2020-05-05 09:15:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Yongqi琦

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by longytu at 2020-05-05 09:15:52
首先确定后对接后一定有氢键吗?一些化合物不容易成氢键

嗯额,知道了,谢谢
3楼2020-05-05 09:59:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
4楼2020-05-05 10:06:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 290求调剂 +3 孔志浩 2026-03-12 8/400 2026-03-15 15:30 by 孔志浩
[考研] 一志愿武理314求调剂 +5 ( ̄~ ̄;) 2026-03-08 6/300 2026-03-15 00:33 by wht0531
[考研] 211本,11408一志愿中科院277分,曾在中科院自动化所实习 +3 Losir 2026-03-12 3/150 2026-03-14 12:11 by 热情沙漠
[考研] 一志愿天大化工(085600)调剂总分338 +6 蔡大美女 2026-03-09 6/300 2026-03-14 02:46 by JourneyLucky
[考研] 293求调剂 +5 上班不着吉 2026-03-09 5/250 2026-03-14 02:37 by JourneyLucky
[考研] 301求调剂 +3 归零lbm 2026-03-09 3/150 2026-03-14 02:20 by JourneyLucky
[考研] 一志愿浙江大学0856材料与化工求调剂 +4 yansheng@211 2026-03-09 5/250 2026-03-14 02:10 by JourneyLucky
[考研] 一志愿郑大070303,338分,求调剂 +4 dadawaf 2026-03-10 5/250 2026-03-14 01:20 by lsw010101
[考研] 265求调剂 +9 小木虫085600 2026-03-09 12/600 2026-03-14 01:11 by JourneyLucky
[考研] 0703求调剂 +7 jtyq001 2026-03-10 7/350 2026-03-14 01:06 by JourneyLucky
[考研] 341求调剂 +4 番茄头--- 2026-03-10 4/200 2026-03-13 23:12 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西南交大,材料专硕317求调剂 +5 lx8568 2026-03-11 5/250 2026-03-13 21:43 by peike
[考研] 【考研调剂求收留】 +3 Ceciilia 2026-03-11 3/150 2026-03-13 20:18 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +5 一定有学上- 2026-03-12 5/250 2026-03-13 18:31 by ms629
[考研] 0703化学求调剂 +7 绿豆芹菜汤 2026-03-12 7/350 2026-03-13 17:25 by njzyff
[考研] 求调剂 +3 程雨杭 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:06 by JourneyLucky
[考研] 085600材料与化工 309分请求调剂 +7 dtdxzxx 2026-03-12 8/400 2026-03-13 14:43 by jxchenghu
[考研] 0817化学工程与技术考研312分调剂 +3 T123 tt 2026-03-12 3/150 2026-03-13 10:49 by houyaoxu
[考博] 福州大学杨黄浩课题组招收2026年专业学位博士研究生,2026.03.20截止 +3 Xiangyu_ou 2026-03-12 3/150 2026-03-13 09:36 by duanwu655
[考研] 081200计算机科学与技术数一英一306求调剂 +3 intankt 2026-03-08 3/150 2026-03-11 10:50 by dandan413
信息提示
请填处理意见