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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » 分子对接，在pymol中形成pdb复合物后，查看相互作用力问题（氢键）
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Yongqi琦

铁虫 (初入文坛)

[求助] 分子对接，在pymol中形成pdb复合物后，查看相互作用力问题（氢键）

使用Autodock vina做完对接后，导入pymol软件查看配体与蛋白的氢键作用，按照教程说的find-polar contacts-to other atoms in objects,却没有显示除氢键。但是直接导入原配体蛋白又可以显示氢键关系，请问有人知道如何处理该问题么？我在对接前处理蛋白，加的是全氢，不是极性氢，有关系么？
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1楼 2020-04-30 23:00:06
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longytu

捐助贵宾 (正式写手)
首先确定后对接后一定有氢键吗？一些化合物不容易成氢键

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2楼2020-05-05 09:15:52
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Yongqi琦

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by longytu at 2020-05-05 09:15:52
首先确定后对接后一定有氢键吗？一些化合物不容易成氢键

嗯额，知道了，谢谢
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3楼2020-05-05 09:59:04
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shawxz2012


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4楼2020-05-05 10:06:49
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wuli.小月

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by longytu at 2020-05-05 09:15:52
首先确定后对接后一定有氢键吗？一些化合物不容易成氢键

楼主能不能分享一下下pymol和autodock软件呀呀呀
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5楼2020-05-27 18:58:36
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ustblh

金虫 (小有名气)
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6楼2020-07-23 22:02:45
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