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Yongqi琦

铁虫 (初入文坛)

[求助] 分子对接,在pymol中形成pdb复合物后,查看相互作用力问题(氢键)

使用Autodock vina做完对接后,导入pymol软件查看配体与蛋白的氢键作用,按照教程说的find-polar contacts-to other atoms in objects,却没有显示除氢键。但是直接导入原配体蛋白又可以显示氢键关系,请问有人知道如何处理该问题么?我在对接前处理蛋白,加的是全氢,不是极性氢,有关系么?
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longytu

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首先确定后对接后一定有氢键吗?一些化合物不容易成氢键

发自小木虫IOS客户端
2楼2020-05-05 09:15:52
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Yongqi琦

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by longytu at 2020-05-05 09:15:52
首先确定后对接后一定有氢键吗?一些化合物不容易成氢键

嗯额,知道了,谢谢
3楼2020-05-05 09:59:04
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4楼2020-05-05 10:06:49
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wuli.小月

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by longytu at 2020-05-05 09:15:52
首先确定后对接后一定有氢键吗?一些化合物不容易成氢键

楼主能不能分享一下下pymol和autodock软件呀呀呀
5楼2020-05-27 18:58:36
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ustblh

金虫 (小有名气)

内容已删除
6楼2020-07-23 22:02:45
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