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【调剂】北京石油化工学院2024年16个专业接受调剂
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beikwx

木虫 (小有名气)


[资源] Sail_Vina 1.0正式版发布(Vina虚拟筛选/反向对接图形界面)

1.0.1更新:http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=12635205

=====================================================

再次感谢@cewinhot对bug的反馈~~

1.0版本经过自己和一些朋友的测试,大致已经没有什么bug,如果有欢迎继续反馈~,更新日志:

1.现在参数全部可以保留,不会重启就删除啦~
2.内置prepare_ligand4,不用再为路径而烦恼
3.新增auto box选项,参考文献方法:
Feinstein WP, Brylinski M. (2015) Calculating an optimal box size for ligand docking and virtual screening against experimental and predicted binding pockets. J Cheminform 7 (1): 18.
文献说可以提高对接效率和准度,自己测试了下感觉还不错。
Sail_Vina 1.0正式版发布(Vina虚拟筛选/反向对接图形界面)

如果使用有问题可以通过邮箱联系:
studyforever0225@gmail.com

务必瞟一下教程

之后的话打算添加几个功能,看之后有没有时间,如果有什么想法可以说,我看看能不能加入进去。
1.柔性受体对接:目前对接方案受体都是刚性的,不过已经满足大部分需求了。
2.分子生成器:指定R基团,替换成各种药物常见基团用于虚拟筛选。

还是再次感谢@cewinhot
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  • 附件 1 : Sail_Vina_v1.0(32位).zip
  • 2018-08-29 21:43:15, 8.83 M
  • 附件 2 : Sail_Vina_v1.0(64位).zip
  • 2018-08-29 21:43:16, 8.69 M
  • 附件 3 : SailVina_tutorial.txt
  • 2018-08-29 21:44:54, 7.73 K

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bbslover

金虫 (正式写手)


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6楼2018-10-14 23:49:57
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冷血孤峰

银虫 (小有名气)


11楼2020-05-21 00:57:55
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木狼人耶

新虫 (小有名气)


12楼2020-05-28 00:02:58
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982512625

铜虫 (小有名气)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

顶下,非常感谢
15楼2022-06-25 20:28:15
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2768952772楼
2018-09-03 17:32   回复  
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wan773楼
2018-09-10 16:29   回复  
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meh。。5楼
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wph6667楼
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wph6668楼
2019-07-29 22:31   回复  
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liumangtu9楼
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聆籁子10楼
2020-01-25 21:40   回复  
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h_lk13楼
2020-07-17 10:18   回复  
送红花一朵
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101645120014楼
2021-03-01 23:22   回复  
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