求助：高斯计算一般顺序是什么？
文献中的计算方法如下：“反应物、产物、中间体和过渡态的结构优化、频率和零点能计算部分采用６－３１＋Ｇ（ｄ，ｐ）基组，单点能计算采用更准确的基组６－３１１＋Ｇ（３ｄｆ，2p）。全部过渡态的内禀反应坐标计算采用的基组和优化采用的基组一致。基于同样的计算水平，水为溶剂选取ＳＭＤ溶剂模型考虑了溶剂效应。”
求助一下，此计算过程中的“结构优化、频率，零点能计算，过渡态的内禀反应坐标计算，溶剂效应”的计算先后顺序是什么？
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京公网安备 11010802022153号
首先溶剂模型需要要从一开始就加在计算里。因为溶剂模型加或者不加优化后的结构不一样。所以如果要用溶剂模型最好所有计算都带上溶剂模型。 高斯用的隐式溶剂模型 就是多几个关键词的事情。
第一步就是用便宜的方法对于所有中间体和过渡态计算 结构优化 频率计算 零点能校正 这几个是同时得到的 关键词就是 opt freq 之后文献里所谓的更准确基组什么的 就是在优化好的结构上再用这个准确基组算一次单点能。
当你得到了优化过的TS结构 为了验证这个结构是否在你想要的反应路径上 就需要做IRC计算也就是所谓的 过渡态的内禀反应坐标计算。
谢谢！很有帮助。
您好，想要重复文献的计算内容的话，首先是需要找出过渡态吗（文献中没有找过渡态的具体方法，能找出跟文献中一样的结构吗？）？
还有一个问题：用优化好的结构在进行单点能计算的操作方法是：把优化的结果（.log/.out）文件中的结构另存为.gjf，然后修改计算方法和link0部分的关键词就行吗？
不知道你总提到link0部分是为什么 。 link0 部分没有什么关键词需要总是进行修改。一般就是 %nproc %mem %chk 这是最常用的三个link0 部分的设置 除了 %chk 需要每个任务根据需要改动 其它基本都不需要改的。
而#之后那些部分比如 计算的方法 计算的类型 就已经不是link0部分了。而这些才属于常常要修改的关键词部分。
单点能计算就是用优化好的结构，另存一个gjf文件。 保持这个结构不变 用别的计算方法来计算单点能。
寻找过渡态如果文献没有给 就需要自己来推测结构 。 然后优化过渡态结构。 优化过渡态的比较常用的相关关键词是 opt(ts,calcfc,noeigentest)
奥~，我好像明白了，原来关键词部分都是直接在job type中选择的，并不需要在link0部分写。分子坐标等也不需要写吧。
一开始以为算例中输入文件的所有内容都是需要在link0中写上的呢。
还有一个问题：反应物、产物、中间体等是需要分别进行优化计算的么？还是都存在一个gjf中一起计算的啊？这些物质的优化有关联吗？
没有关联 反应物 产物 中间体 过渡态 都需要分开单独计算的。
嗯嗯，非常感谢，感觉终于明白一点了
还是有地方不太明白：高斯使用手册中的输入文件（具体指的是什么？ 只需要选择计算的关键词，不需要手写加入别的内容么）的例子（如下图），都包括关键词，分子坐标等等，这个应该是写在哪里的呢？还有的是多个任务，输入文件后还有--link1--这种的，是如何进行计算的呢？
还有说第二行第四行需要空行等这些内容，应该在哪部分输入呢？
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