24小时热门版块排行榜    

申请当版主 | 存档区 |应助排行|模拟EPI排行 小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 订阅

管理团队 (金币库 69390.4 充值 )

主管区长：
月只蓝小红豆
主管版主：
abinitio沙漠猎人

杰出贡献者

专家顾问：
pigrassoxox6085lsloneilbrucefanjerkwin
荣誉版主：
wuli8lei0736nono2009fegg7502ghcacjzzy870720zuuv2010御剑江湖yjcmwgkjiaoyixiongcenwanglaiben_ladengljw4010
荣誉成员：
余泽成
20942107/210首页上一页105106107108109110下一页
全部 专家会诊 MS LAMMPS/DL_POLY Gromacs/Amber/NAMD DS/Sybyl/Autodock Monte Carlo ME/Gulp Hyperchem CPMD/CP2K 资源 其他 版务
回帖排序 发表排序 刷新页面  |  交流  |  求助  |  资源精华区 作者 最后发表
[热点] 救命帖 xiaoyu2022 2026-01-27 刚刚
[MS] [已完结]求emimTf2N 和 H2O以1:1混溶的密度值，拜托拜托 (评阅+1) (0/234) 岳丽丽75 2015-04-21 2015-04-21 10:21:35 by 岳丽丽75
[LAMMPS/ ] 粗粒化模拟（CG）问题请教 (评阅+1) (2/1769) bmnce 2015-04-20 2015-04-21 10:01:02 by bmnce
[MS] [已完结]discover模块无法提交任务到MS7.0 linux，其他模块正常。 (评阅+1) (4/692) youzics 2014-12-28 2015-04-21 08:28:46 by memgr
[MS] [已完结]文件损坏？ (评阅+1) (1/298) 张益坤 2015-04-20 2015-04-21 07:30:08 by abinitio
[DS/Syby ] [已完结]【求助】autodock结果用pymol打开氨基酸结构错乱影响作图 (评阅+1) (4/1121) xiaofeng514 2014-04-19 2015-04-21 06:52:39 by xiaofeng514
[专家会诊] 各分子动力学软件的相同和不同点比较与分析。 (评阅+1) (模拟EPI+1)(2/2385) lianggreen 2015-04-20 2015-04-21 05:21:09 by lsloneil
[Gromacs ] [已完结]请问如何生成碳纳米管或者石墨烯的itp文件？ (评阅+1) (1/1089) lingogo 2015-04-18 2015-04-21 02:18:38 by jerkwin
[MS] [已完结]求助 有关染料分子在水里中的分子模拟 (评阅+2) (2/397) guizi8668 2015-04-19 2015-04-21 02:12:39 by jerkwin
[LAMMPS/ ] 【求助】分子动力学中体系温度不断增加?    ( 1 2 ) (评阅+1) (16/3443) weizhiyong 2010-09-12 2015-04-20 15:58:49 by 奈落之夜
[MS] [已完结]RBM frequency 怎么计算？ (评阅+1) (2/408) 小虫_sang 2014-07-23 2015-04-20 12:06:44 by cedarxmc
[专家会诊] [已完结]tinker添加周期性边界条件求助！谢谢 (评阅+1) (0/443) lishuying89 2015-04-20 2015-04-20 09:13:23 by lishuying89
[Gromacs ] [已完结]如何将amber的轨迹文件mdcrd格式转换成gromacs的轨迹文件格式 trr呢 (评阅+1) (5/4137) zjahu 2014-05-21 2015-04-20 07:47:38 by chenhang07
[LAMMPS/ ] [已完结]lammps能量最小化，其方法？适用场合？ (评阅+1) (7/4695) 学术虫。。。 2014-02-21 2015-04-20 07:12:33 by 取什么名字呢
[Gromacs ] [已完结]amber如何终止模拟过程 (评阅+1) (1/445) 飘渺青莲 2015-04-11 2015-04-19 22:15:53 by lrf1980
[Gromacs ] [已完结]Amber 怎么查看任务计算进展 (评阅+1) (3/764) 高敏WXP 2015-03-23 2015-04-19 22:07:42 by lrf1980
[MS] [已完结]分子结构3D画图求助 (评阅+1) (3/1298) 横刀 2014-04-26 2015-04-19 14:26:06 by 蓝洋飘雪
[Gromacs ] [已完结]关于编程获得 截角八面体 金纳米颗粒 的模型结构 (6/1474) 飘飞1 2013-08-05 2015-04-19 12:27:25 by chenxj2013
[其他] [已完结]隐性溶剂下分子动力学模拟力场和模型问题 (评阅+1) (1/550) 小小刘亚男 2015-04-17 2015-04-19 01:40:50 by 兰S水晶
[MS] [已完结]我做了一个分子动力学不会分析 (评阅+1) (1/428) yaohongxx 2015-04-18 2015-04-18 17:05:07 by 声梦奇缘001
[MS] [已完结]有机物水溶液与聚合物作用该怎么模拟 (评阅+1) (0/264) 唱歌给你听dc 2015-04-18 2015-04-18 10:58:45 by 唱歌给你听dc
[Gromacs ] [已完结]gromacs 怎么生成or怎么获取 含有非标准原子硼的小分子力场文件（例如苯硼酸） (评阅+1) (3/872) tbw258 2015-04-11 2015-04-17 21:35:20 by tbw258
[MS] [已完结]对文献中的计算公式的不理解 (评阅+1) (0/465) YeHJ1992 2015-04-17 2015-04-17 20:43:00 by YeHJ1992
[LAMMPS/ ] [已完结]阿尔法石英有没有二面角？ (评阅+1) (0/418) jane8556 2015-04-17 2015-04-17 19:52:26 by jane8556
[MS] [已完结]怎么使用MS对纤维素分子体系施加电场呀！ (4/841) 撼地毛牛 2013-02-27 2015-04-17 19:24:20 by 尚优莫喜
[专家会诊] [已完结]VMD的Fit功能的使用 (评阅+1) (0/615) L_先森 2015-04-17 2015-04-17 18:40:18 by L_先森
[其他] polylfow能用于模拟反应问题 (评阅+1) (7/436) Vipwinnergao 2015-04-15 2015-04-17 16:58:21 by qqaoqq
[DS/Syby ] [已完结][关贴]autodock vina里box参数一定。结果为什么会有几个在box外面了。给配体加电荷怎么是0.0 (评阅+1) (2/1338) fan728516414 2015-04-14 2015-04-17 16:34:22 by fan728516414
[其他] 【求助】Error: tensor element equals to 0 for a divide operation (4/927) herarysara 2010-05-26 2015-04-17 16:09:25 by zhang_heng
[Gromacs ] MS生成的石墨烯和纳米管导出后使用vmd的问题 (评阅+1) (3/1438) nufang19a 2011-06-03 2015-04-17 12:25:08 by tobetheone
[MS] [已完结]MS 做出的能带图粘贴到Origin中，怎么确定横坐标呢？ (评阅+1) (1/1064) 漠河以北 2015-04-14 2015-04-17 09:23:00 by 举火烧天
[资源] [已完结]请问哪位有 MOE for MAC、Gold for MAC 可不可以发给我一份？ (1/1273) 点点的风光 2015-04-16 2015-04-17 09:21:58 by pigrass
[MS] [已完结]请问用MS做动力学和用LAMMPS做动力学的差别，其他的参数都可以设置成一样的 (评阅+1) (1/1830) 石勤 2015-04-16 2015-04-17 08:29:38 by 赵红霞
[LAMMPS/ ] 运行lammps时出现“段错误”是什么错误，在手册里只用英文error (评阅+1) (1/1100) windsor2010 2015-04-16 2015-04-17 04:40:20 by lsloneil
[MS] [已完结]chem office3D里MOPAC在安装的奇怪问题 (评阅+1) (1/970) 敏小木 2015-04-13 2015-04-16 16:44:12 by tbw258
[MS] [已完结]求助钴原子力场参数 (评阅+1) (1/634) 猫头鹰love 2015-04-12 2015-04-16 16:43:17 by tbw258
[Gromacs ] [已完结]gromacs做膜蛋白如何调整膜的位置 (评阅+1) (5/908) Paris7081 2015-04-15 2015-04-16 12:46:18 by jerkwin
[MS] [已完结]水盒子的建模问题    ( 1 2 ) (评阅+1) (11/1978) 4443223 2015-03-15 2015-04-16 10:18:00 by dezuun
[LAMMPS/ ] [已完结]有多个势，其中包括reax势的时候应该怎么写？ (4/2080) hkuieagle 2012-12-03 2015-04-16 07:32:04 by 14B927045
[LAMMPS/ ] [已完结]从lammps模拟使用的势函数画出势能曲线 (评阅+1) (0/1874) 欢乐英豪 2015-04-15 2015-04-15 21:53:02 by 欢乐英豪
[MS] [已完结]利用nvt系宗跑分子动力学遇到的问题    ( 1 2 ) (12/1773) xiaoke413 2013-04-14 2015-04-15 21:10:39 by chaoxiaozhu
[其他] [已完结]请问PDB数据库里的length是指单体的大小码? (2/685) bobofof 2015-04-15 2015-04-15 20:26:16 by bobofof
[LAMMPS/ ] lammps编译出错 (评阅+1) (0/752) bluejh 2015-04-15 2015-04-15 19:22:50 by bluejh
[MS] [已完结]做sorption时，修改dreiding力场问题 (7/1812) xj200920075 2015-03-17 2015-04-15 16:45:54 by Sophiezx45
[MS] [已完结]求助emimTf2N做动力学模拟时做key文件所需要的力场参数，emim+已有，Tf2N-的求帮助 (评阅+1) (4/777) 岳丽丽75 2015-04-14 2015-04-15 16:45:47 by tianlangxingaa
[LAMMPS/ ] [已完结]mutual diffussion coefficient的计算模拟 (评阅+1) (3/2533) cenwanglai 2014-04-07 2015-04-15 14:34:25 by 果果lou
[MS] [已完结]如何用MS计算液态水的电偶极矩 得到远红外光谱 (1/1000) fuxiuhua 2012-01-04 2015-04-15 14:18:23 by hxxywwp89
[MS] [已完结]怎么把Discover动力学完成后的轨迹文件提取出来？    ( 1 2 ) (10/2581) voleyes 2011-11-06 2015-04-15 13:03:02 by caoliang110
[LAMMPS/ ] [已完结]求PLUMED2安装源文件（tar.gz） (评阅+1) (1/1022) issp-hao 2015-04-12 2015-04-15 09:22:18 by issp-hao
[MS] [已完结]MS模拟怎么把北京调成白色？？？ (评阅+1) (2/567) aa2349439 2015-04-13 2015-04-14 21:53:14 by lx_PICO
[LAMMPS/ ] [已完结][关贴]编译安装 (评阅+2) (0/282) 迷失的自我 2015-04-14 2015-04-14 19:09:10 by 迷失的自我
[Gromacs ] [已完结]mdp文件中约束算法的设置 (评阅+1) (0/451) 吉米爱多 2015-04-14 2015-04-14 18:26:18 by 吉米爱多
[LAMMPS/ ] 有人用LAMMPS建过铁中包含铜沉淀的模型吗？ (评阅+1) (0/202) lx_PICO 2015-04-14 2015-04-14 16:20:28 by lx_PICO
[专家会诊] [已完结]高斯09优化出错，氢氧化钠溶剂该怎么写 (评阅+1) (2/1126) lcl19870223 2015-04-11 2015-04-14 08:55:39 by 赵红霞
[专家会诊] [已完结]使用berendsen方法控温控压问题    ( 1 2 ) (评阅+1) (15/2403) 解子林 2014-01-05 2015-04-14 07:50:29 by jx3551992
[MS] [已完结]CASTEP里怎么计算乙氧基的能量 (评阅+1) (1/310) qpccd1989 2015-04-13 2015-04-13 21:24:31 by qpccd1989
[MS] [已完结]Amorphous cell-construction中的number of configuration的值设置多少为好？ (6/1846) ammytao 2013-11-25 2015-04-13 19:15:24 by 锅是铁
[LAMMPS/ ] 【讨论】【lammps】位错及其类型判断 (4/4586) zhangyanjenny 2010-07-09 2015-04-13 17:16:06 by 桃苦亦兮
[MS] [已完结][关贴]MS中结合能和生成焓的计算 (评阅+1) (0/2530) zhaobozhou 2015-04-13 2015-04-13 16:44:34 by zhaobozhou
[DS/Syby ] [已完结]Autodock对接dlg格式文件中出现问题 (6/2318) panfangli 2013-06-25 2015-04-13 13:14:13 by panfangli
[Gromacs ] [已完结]opls力场里opls_199的原子类型是什么？ (评阅+1) (4/1169) 吉米爱多 2015-04-09 2015-04-13 12:34:43 by 吉米爱多
[LAMMPS/ ] [已完结]压痕模拟压头不动问题 (评阅+1) (4/1232) lcywjm1217 2015-04-09 2015-04-13 12:03:42 by lx_PICO
[MS] g09 激发态计算问题 (5/934) hanqingyan 2013-04-17 2015-04-13 11:29:33 by xzh410512206
[Gromacs ] [已完结]模拟完成后的分析问题 (评阅+1) (1/403) 玖月之殇 2015-04-13 2015-04-13 11:26:43 by visualization
[专家会诊] [已完结]体系中有很多水分子，如何用rattle命令限制水分子的类型和键长键角    ( 1 2 ) (14/2732) upc穆宁 2013-12-24 2015-04-13 07:04:43 by Sophiezx45
[MS] [已完结]粗粒化模型问题 (评阅+1) (5/2681) Andsharia 2014-05-16 2015-04-13 06:55:26 by zengyong400
[LAMMPS/ ] [已完结]dihedral_fourier中di代表phase shift?如何得到这个参数？ (评阅+1) (0/245) mydnh52 2015-04-12 2015-04-12 21:12:53 by mydnh52
[ME/Gulp] 用mateials explorer做应变速率控制的拉伸加载时，如何提取出应力应变曲线？ (评阅+1) (1/631) youleer 2015-04-09 2015-04-12 18:54:45 by houchaojian
[MS] [已完结][关贴]用MS计算材料机械性能的问题 (评阅+1) (0/1580) 奇幻之旅 2015-04-12 2015-04-12 17:44:53 by 奇幻之旅
[LAMMPS/ ] [已完结]lammps计算数据异常 (评阅+1) (0/466) lcywjm1217 2015-04-12 2015-04-12 16:14:43 by lcywjm1217
[Gromacs ] [已完结]求大神帮忙得到一个分析方法，拜托！拜托！！！    ( 1 2 ) (评阅+1) (10/945) 白玉浴血 2015-04-08 2015-04-12 11:27:36 by 白玉浴血
[LAMMPS/ ] [已完结][关贴]lammps模拟屈曲过程中遇到的问题 (评阅+1) (5/760) 好久不见-321 2015-04-10 2015-04-12 09:29:01 by 好久不见-321
[LAMMPS/ ] 我建模的体系region为圆柱，怎么设置晶格lattice类型 (评阅+1) (0/325) windsor2010 2015-04-11 2015-04-11 22:55:10 by windsor2010
[LAMMPS/ ] [已完结][关贴]lammps里有关蒸发的命令 (0/1201) 飞利白 2015-04-11 2015-04-11 22:08:40 by 飞利白
[LAMMPS/ ] [已完结]lammps报错 (评阅+1) (2/1500) 飞利白 2015-04-06 2015-04-11 21:51:04 by 飞利白
[MS] 如何看出物质状态是气体还是液体 (评阅+1) (4/948) dying999 2015-04-10 2015-04-11 18:01:17 by 8wangle
[Gromacs ] [已完结]Gromacs新人求助 (评阅+1) (0/320) Terra白骨精 2015-04-10 2015-04-10 20:43:50 by Terra白骨精
[MS] 输出模型数据用的.mol文件，数据长了两个数据会接连或者直接不能保存怎么解决？ (评阅+1) (0/489) windsor2010 2015-04-10 2015-04-10 17:42:18 by windsor2010
[DS/Syby ] [已完结]没有晶体机构的靶点 怎么做计算？该怎么回答审稿人 (3/547) realkaka 2015-04-10 2015-04-10 16:29:22 by 后觉
[MS] [已完结]不同有机物分子与聚合物链的作用 (评阅+1) (0/304) 孙晓龙1990 2015-04-10 2015-04-10 16:25:01 by 孙晓龙1990
[Monte C ] [已完结]径向分布函数积分问题 (评阅+1) (4/1504) 809011916 2015-04-07 2015-04-10 11:28:49 by 809011916
[LAMMPS/ ] [已完结]怎样对体系中部分原子使用npt？ (评阅+1) (0/595) tyfx123 2015-04-10 2015-04-10 10:41:44 by tyfx123
[MS] [已完结]MS导入cif文件晶胞中分子数的确定方法 (评阅+1) (7/2428) 嗨皮你我 2015-04-04 2015-04-10 09:23:53 by pigrass
[其他] [已完结]请问有没有对Autodock进行全面介绍的资料？ (评阅+1) (8/1311) 兔子8888 2015-04-06 2015-04-10 00:34:28 by createsun
[Monte C ] 【原创】那篇经典的理想吸附溶液理论文献 (评阅+5) (2/2435) zyj8119 2010-09-16 2015-04-09 18:55:52 by Ronny_chou
[DS/Syby ] [已完结][关贴]求助AUTODOCK 加氢问题 (4/2365) joy11 2015-04-09 2015-04-09 15:23:44 by joy11
[其他] [已完结][关贴]VMD 非官方插件Diffusion Coefficient Tool在linux系统下安装问题 (0/958) gn02530640 2015-04-09 2015-04-09 12:36:17 by gn02530640
[LAMMPS/ ] [已完结]求助一维分子链的LAMMPS的in和data文件，也就是模拟一维分子链的例子 (评阅+1) (0/366) 傲梅映雪 2015-04-09 2015-04-09 12:19:51 by 傲梅映雪
[专家会诊] materials studio中怎么在一个晶格中添加水分子啊？！！求大神解答 (评阅+1) (0/4096) vyckii 2015-04-09 2015-04-09 10:40:20 by vyckii
[其他] [已完结]细胞膜模拟源程序 (评阅+1) (4/697) tangxingyi 2015-04-05 2015-04-09 10:02:06 by visualization
[LAMMPS/ ] [已完结]分子动力学中计算出的原子总能和原子的电离能比较可以判断原子是否发生电离吗 (3/936) MDeFF2012 2015-03-25 2015-04-09 09:36:28 by lsloneil
[DS/Syby ] [已完结]DS建药效团，null cost−total cost和RMS值偏大，是什么原因，应该如何解决？ (1/973) erin19911203 2015-03-09 2015-04-09 09:22:25 by 小柒_92
[专家会诊] [已完结]求cfd催化反应案例 (评阅+1) (0/250) 080lusiqi 2015-04-09 2015-04-09 08:50:22 by 080lusiqi
[MS] [已完结]AC建模及Discover能量最小化    ( 1 2 ) (11/2070) mirror27 2012-01-05 2015-04-09 06:27:51 by 锅是铁
[其他] [已完结]高斯DFT模拟分子构型后怎么看分子尺度 (评阅+1) (0/593) dingyi8289 2015-04-08 2015-04-08 21:15:26 by dingyi8289
[LAMMPS/ ] lammps模拟的一个脚本文件可以有两种atom_style吗？ (评阅+1) (1/1435) windsor2010 2015-04-07 2015-04-08 18:35:38 by fei5122917
[DS/Syby ] [已完结]关于受体酶活性位点的叠加 (评阅+1) (1/361) 雷时海200 2015-03-29 2015-04-08 16:49:36 by weishuang
[MS] [关贴]涂层界面分子动力学模拟~ (评阅+1) (9/1950) c1990427365 2015-03-30 2015-04-08 14:24:22 by c1990427365
[专家会诊] [已完结]新手求问：autodock和MD之间有什么区别啊？ (评阅+1) (1/966) xinr2010 2015-03-30 2015-04-08 13:52:24 by z253642075
[MS] [已完结]discover分子动力学问题 (评阅+1) (0/403) mzlwait 2015-04-08 2015-04-08 13:45:30 by mzlwait
20942107/210首页上一页105106107108109110下一页
相关版块跳转
查看