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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 模拟完成后的分析问题
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玖月之殇

新虫 (初入文坛)

[求助] 模拟完成后的分析问题

本人对分子模拟处于初步了解阶段，现在是知其然不知其所以然。
采用gromacs跑了一系列模拟，想对其进行下分析，不知到从什么地方入手！！！！
现在想分析一下表活剂对油水界面的影响，我应该取哪些方面的数据来进行分析，例如界面生成能，扩散系数
界面生成能我需要什么数据
扩散系数我需要什么数据
可能我问的问题比较小白，但这确实难倒我了，也查过很多相关的文献，有些思路却不清晰。
请大神们帮帮忙，帮忙梳理一下。求详细讲解
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1楼 2015-04-13 09:43:27
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visualization

金虫 (小有名气)
看看手册里那些个分析工具介绍吧，比如扩散系数g_msd，按照手册里说的操作一遍，能量g_energy
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2楼2015-04-13 11:26:43
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