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L_先森

新虫 (初入文坛)

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专业: 化学反应工程

[求助] VMD的Fit功能的使用

请各位大神指点一个问题！！！
本人用VMD软件的Fit功能，希望将现有的颗粒结构与FCC结构相比较，求结构的均方根偏差RMSD。但目前发现，利用Align只能将颗粒结构与FCC结构样本的质点平移到一起，好像没有将结构旋转去寻找最佳的匹配位置。如何才能将需要比较的两个结构以质心为原点去旋转寻找最佳的匹配位置，并求出最小均方根偏差？
请大家多多指点~

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1楼 2015-04-17 18:40:18

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