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吉米爱多铁杆木虫 (著名写手)
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mdp文件中约束算法的设置
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| constraint-algorithm在manual里给了LINCS和SHAKE两种选择，我选择了SHAKE算法，但是在生成的mdout.mdp文件中还是会有lincs_iter = 1 以及lincs_order = 4 这两项。这是为什么呢？另：LINCS和SHAKE这两种算法，如果再constraints=none的情况下，有什么区别？键长键角都没有限制了，限制算法还有差异吗？ |
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