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求助使用lammps进行粗粒化模拟的要点 已有1人参与
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| 刚接触lammps不久，课题需要用lammps进行粗粒化模拟，自己看了mannual很久，对pair_style以及力场的设置不是很了解，想麻烦有了解的虫友能够提供一些指导，也可以交流，如果能有一些资源提供就更好了，不胜感激。 |
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【答案】应助回帖
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请仔细搜索阅读本版内关于粗粒化的一些回帖，比如这个 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=8450437 粗粒化只是一种力场，粗粒化力场参数的获取大多都是通过其他方式计算和拟合得到的，LAMMPS能做的不是获得力场参数，而是用已知力场参数进行模拟。 粗粒化力场很多，很多都是针对不同的需要的，你应该根据自己体系的需要，选择合适的粗粒化力场。比较有名的，像MARTINI，都是要额外的程序才能获得这些参数的：http://md.chem.rug.nl/cgmartini/index.php/downloads 又如DPD，DPD参数的获得也有它自己的一套方法，一般是通过Flory-Huggins参数来获得，具体怎么获得自己看文献。 又如水分子，有很多文章是拟合粗粒化水分子的力场的。 |
6楼2015-04-23 15:02:52
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