| 查看: 3580 | 回复: 10 | ||
赵红霞铁杆木虫 (著名写手)
|
[求助]
MS粗粒化模型如何导入lammps 已有2人参与
|
|
|
如题,我在MS里建立聚合物的粗粒化模型,并用martini分配力场,但是不知道如何转化为lammps所需要的文件,请高手指教 本人做溶液环境下聚合物链的自组装,有几个问题请教(问题1,2,3,是同样的问题,我怕说不清楚所以分条说) 1. 做多条链的自组装,在MS里建粗粒化的聚合物链,是建一条链导入lammps,然后用命令可以建出多条链, 还是直接需要在MS里建多条链然后导入到lammps? 2. 关于溶液的问题,这个和问题1类似,比如我要建水分子的粗粒化,是只要建一个水珠子还是需要直接建N个水珠子再导入? 3. 在MS里分别建好各个分子,导入lammps,在lammps里组装,还是直接先在MS里组装好,粗粒化,再直接导入lammps? 4. 在MS里保存成什么文件类型,在哪里用什么命令转化?转化之后如何查看初始模型? |
» 猜你喜欢
职称评审没过,求安慰
已经有41人回复
回收溶剂求助
已经有7人回复
硝基苯如何除去
已经有3人回复
A期刊撤稿
已经有4人回复
垃圾破二本职称评审标准
已经有17人回复
投稿Elsevier的Neoplasia杂志,到最后选publishing options时页面空白,不能完成投稿
已经有22人回复
EST投稿状态问题
已经有7人回复
毕业后当辅导员了,天天各种学生超烦
已经有4人回复
求助文献
已经有3人回复
三无产品还有机会吗
已经有6人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
LAMMPS和DL-POLY是否能同时调用两个力场
已经有4人回复
分子模拟初学者,求一个gamma-AL2O3模型
已经有7人回复
粗粒化模型建模之后分配力场问题
已经有14人回复
粗粒化模型问题
已经有5人回复
环己烷在gromacs中的gromos45a3力场中的itp文件怎么写?
已经有12人回复
MS模型怎么导出lammps能读取的文件?win7系统
已经有8人回复
粗粒化模拟求助
已经有6人回复
请问gromacs导入EAM势能函数的问题和lammps导入martini粗粒化力场的问题
已经有4人回复
ms建模指定力场导入lammps后是否需要引入势函数
已经有3人回复
MS模拟 周期性条件 没有看到分子进入模拟盒
已经有5人回复
【求助】关于LAMMPS建模
已经有9人回复
关于DNA连接的纳米粒子自组装的分子动力学模拟,求交流和分享
已经有15人回复
MS分子模拟真空势箱
已经有22人回复
经过MS模型导入到LAMMPS,在运算时出现的错误求助
已经有22人回复
Gromacs粗粒化力场(自己写)
已经有11人回复
ms构建好的模型转化为lammps data文件
已经有5人回复
分子动力学模拟力场
已经有13人回复
ms模型导入lammps
已经有8人回复
怎样把material studio中sio2的模型数据导入lammps中
已经有9人回复
100-200纳米的胶体颗粒在固壁面上沉积成膜过程仿真用哪个软件更好
已经有3人回复
用MS建模导入LAMMPS计算,是不是不能用compass力场?
已经有9人回复
水分子建模方法
已经有6人回复
在LAMMPS中怎么建立图示的模型
已经有6人回复
【求助】MS建模导入lammps问题求救
已经有14人回复
赵红霞
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 73 (初中生)
- 金币: 6186.9
- 散金: 141
- 红花: 33
- 帖子: 1540
- 在线: 699小时
- 虫号: 1544094
- 注册: 2011-12-20
- 性别: MM
- 专业: 理论和计算化学
2楼2014-09-04 15:34:18
wjl1314
银虫 (小有名气)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 1531.1
- 红花: 1
- 帖子: 86
- 在线: 208.5小时
- 虫号: 1447444
- 注册: 2011-10-17
- 专业: 有机分子功能材料化学
3楼2014-09-05 15:19:23
赵红霞
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 73 (初中生)
- 金币: 6186.9
- 散金: 141
- 红花: 33
- 帖子: 1540
- 在线: 699小时
- 虫号: 1544094
- 注册: 2011-12-20
- 性别: MM
- 专业: 理论和计算化学
5楼2014-09-09 09:03:18
8楼2017-12-01 20:31:21
linwh
木虫 (小有名气)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 4298.6
- 红花: 2
- 帖子: 186
- 在线: 100.8小时
- 虫号: 2403025
- 注册: 2013-04-05
- 性别: GG
- 专业: 固体力学
4楼2014-09-05 16:47:56
linwh
木虫 (小有名气)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 4298.6
- 红花: 2
- 帖子: 186
- 在线: 100.8小时
- 虫号: 2403025
- 注册: 2013-04-05
- 性别: GG
- 专业: 固体力学
6楼2014-09-11 16:12:51
冷风中
金虫 (著名写手)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 3130.5
- 散金: 15
- 红花: 3
- 帖子: 1089
- 在线: 301.5小时
- 虫号: 3937449
- 注册: 2015-06-24
- 专业: 有机合成
7楼2017-02-18 22:37:06
赵红霞
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 73 (初中生)
- 金币: 6186.9
- 散金: 141
- 红花: 33
- 帖子: 1540
- 在线: 699小时
- 虫号: 1544094
- 注册: 2011-12-20
- 性别: MM
- 专业: 理论和计算化学
9楼2017-12-03 10:32:48
赵红霞
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 73 (初中生)
- 金币: 6186.9
- 散金: 141
- 红花: 33
- 帖子: 1540
- 在线: 699小时
- 虫号: 1544094
- 注册: 2011-12-20
- 性别: MM
- 专业: 理论和计算化学
10楼2017-12-03 10:35:12













回复此楼
冷风中