| 查看: 3695 | 回复: 10 | ||
赵红霞铁杆木虫 (著名写手)
|
[求助]
MS粗粒化模型如何导入lammps 已有2人参与
|
|
|
如题，我在MS里建立聚合物的粗粒化模型，并用martini分配力场，但是不知道如何转化为lammps所需要的文件，请高手指教 本人做溶液环境下聚合物链的自组装，有几个问题请教（问题1,2,3,是同样的问题，我怕说不清楚所以分条说） 1. 做多条链的自组装，在MS里建粗粒化的聚合物链，是建一条链导入lammps，然后用命令可以建出多条链， 还是直接需要在MS里建多条链然后导入到lammps？ 2. 关于溶液的问题，这个和问题1类似，比如我要建水分子的粗粒化，是只要建一个水珠子还是需要直接建N个水珠子再导入？ 3. 在MS里分别建好各个分子，导入lammps，在lammps里组装，还是直接先在MS里组装好，粗粒化，再直接导入lammps？ 4. 在MS里保存成什么文件类型，在哪里用什么命令转化？转化之后如何查看初始模型？ |
回复此楼» 猜你喜欢
070300化学学硕求调剂
已经有3人回复
-
0854控制工程 359求调剂 可跨专业
已经有8人回复
-
国自科面上基金字体
已经有6人回复
-
304求调剂
已经有3人回复
-
304求调剂
已经有6人回复
-
材料与化工一志愿南昌大学327求调剂推荐
已经有8人回复
-
0703 物理化学调剂
已经有5人回复
-
化学工程321分求调剂
已经有7人回复
-
0703化学调剂 290分有科研经历，论文在投
已经有7人回复
-
308求调剂
已经有3人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- LAMMPS和DL-POLY是否能同时调用两个力场
已经有4人回复
- 分子模拟初学者，求一个gamma-AL2O3模型
已经有7人回复
- 粗粒化模型建模之后分配力场问题
已经有14人回复
- 粗粒化模型问题
已经有5人回复
- 环己烷在gromacs中的gromos45a3力场中的itp文件怎么写？
已经有12人回复
- MS模型怎么导出lammps能读取的文件？win7系统
已经有8人回复
- 粗粒化模拟求助
已经有6人回复
- 请问gromacs导入EAM势能函数的问题和lammps导入martini粗粒化力场的问题
已经有4人回复
- ms建模指定力场导入lammps后是否需要引入势函数
已经有3人回复
- MS模拟 周期性条件 没有看到分子进入模拟盒
已经有5人回复
- 【求助】关于LAMMPS建模
已经有9人回复
- 关于DNA连接的纳米粒子自组装的分子动力学模拟，求交流和分享
已经有15人回复
- MS分子模拟真空势箱
已经有22人回复
- 经过MS模型导入到LAMMPS，在运算时出现的错误求助
已经有22人回复
- Gromacs粗粒化力场（自己写）
已经有11人回复
- ms构建好的模型转化为lammps data文件
已经有5人回复
- 分子动力学模拟力场
已经有13人回复
- ms模型导入lammps
已经有8人回复
- 怎样把material studio中sio2的模型数据导入lammps中
已经有9人回复
- 100-200纳米的胶体颗粒在固壁面上沉积成膜过程仿真用哪个软件更好
已经有3人回复
- 用MS建模导入LAMMPS计算，是不是不能用compass力场？
已经有9人回复
- 水分子建模方法
已经有6人回复
- 在LAMMPS中怎么建立图示的模型
已经有6人回复
- 【求助】MS建模导入lammps问题求救
已经有14人回复
赵红霞
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 73 (初中生)
- 金币: 6197.9
- 散金: 141
- 红花: 33
- 帖子: 1541
- 在线: 700小时
- 虫号: 1544094
- 注册: 2011-12-20
- 性别: MM
- 专业: 理论和计算化学
2楼2014-09-04 15:34:18
wjl1314
银虫 (小有名气)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 1531.1
- 红花: 1
- 帖子: 86
- 在线: 208.5小时
- 虫号: 1447444
- 注册: 2011-10-17
- 专业: 有机分子功能材料化学
3楼2014-09-05 15:19:23
赵红霞
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 73 (初中生)
- 金币: 6197.9
- 散金: 141
- 红花: 33
- 帖子: 1541
- 在线: 700小时
- 虫号: 1544094
- 注册: 2011-12-20
- 性别: MM
- 专业: 理论和计算化学
冷风中5楼2014-09-09 09:03:18
8楼2017-12-01 20:31:21
linwh
木虫 (小有名气)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 4298.6
- 红花: 2
- 帖子: 186
- 在线: 100.8小时
- 虫号: 2403025
- 注册: 2013-04-05
- 性别: GG
- 专业: 固体力学
4楼2014-09-05 16:47:56
linwh
木虫 (小有名气)
- 应助: 9 (幼儿园)
- 金币: 4298.6
- 红花: 2
- 帖子: 186
- 在线: 100.8小时
- 虫号: 2403025
- 注册: 2013-04-05
- 性别: GG
- 专业: 固体力学
6楼2014-09-11 16:12:51
冷风中
金虫 (著名写手)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 3130.5
- 散金: 15
- 红花: 3
- 帖子: 1089
- 在线: 301.5小时
- 虫号: 3937449
- 注册: 2015-06-24
- 专业: 有机合成
7楼2017-02-18 22:37:06
赵红霞
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 73 (初中生)
- 金币: 6197.9
- 散金: 141
- 红花: 33
- 帖子: 1541
- 在线: 700小时
- 虫号: 1544094
- 注册: 2011-12-20
- 性别: MM
- 专业: 理论和计算化学
9楼2017-12-03 10:32:48
赵红霞
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 73 (初中生)
- 金币: 6197.9
- 散金: 141
- 红花: 33
- 帖子: 1541
- 在线: 700小时
- 虫号: 1544094
- 注册: 2011-12-20
- 性别: MM
- 专业: 理论和计算化学
10楼2017-12-03 10:35:12
20