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赵红霞铁杆木虫 (著名写手)
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MS粗粒化模型如何导入lammps 已有2人参与
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如题,我在MS里建立聚合物的粗粒化模型,并用martini分配力场,但是不知道如何转化为lammps所需要的文件,请高手指教 本人做溶液环境下聚合物链的自组装,有几个问题请教(问题1,2,3,是同样的问题,我怕说不清楚所以分条说) 1. 做多条链的自组装,在MS里建粗粒化的聚合物链,是建一条链导入lammps,然后用命令可以建出多条链, 还是直接需要在MS里建多条链然后导入到lammps? 2. 关于溶液的问题,这个和问题1类似,比如我要建水分子的粗粒化,是只要建一个水珠子还是需要直接建N个水珠子再导入? 3. 在MS里分别建好各个分子,导入lammps,在lammps里组装,还是直接先在MS里组装好,粗粒化,再直接导入lammps? 4. 在MS里保存成什么文件类型,在哪里用什么命令转化?转化之后如何查看初始模型? |
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