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Y224365

木虫 (小有名气)

[求助] 求助使用lammps进行粗粒化模拟的要点 已有1人参与

刚接触lammps不久,课题需要用lammps进行粗粒化模拟,自己看了mannual很久,对pair_style以及力场的设置不是很了解,想麻烦有了解的虫友能够提供一些指导,也可以交流,如果能有一些资源提供就更好了,不胜感激。
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lsloneil

专家顾问 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
Y224365: 金币+20, ★★★很有帮助 2015-04-24 21:36:35
请仔细搜索阅读本版内关于粗粒化的一些回帖,比如这个
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=8450437

粗粒化只是一种力场,粗粒化力场参数的获取大多都是通过其他方式计算和拟合得到的,LAMMPS能做的不是获得力场参数,而是用已知力场参数进行模拟。

粗粒化力场很多,很多都是针对不同的需要的,你应该根据自己体系的需要,选择合适的粗粒化力场。比较有名的,像MARTINI,都是要额外的程序才能获得这些参数的:http://md.chem.rug.nl/cgmartini/index.php/downloads

又如DPD,DPD参数的获得也有它自己的一套方法,一般是通过Flory-Huggins参数来获得,具体怎么获得自己看文献。

又如水分子,有很多文章是拟合粗粒化水分子的力场的。
6楼2015-04-23 15:02:52
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查看全部 6 个回答

abinitio

版主 (著名写手)

粗粒化模拟很火吗?最近相关的求助不少呀
2楼2015-04-23 09:17:36
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫里搜一搜,资料一大把
3楼2015-04-23 09:18:10
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Y224365

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by abinitio at 2015-04-23 09:17:36
粗粒化模拟很火吗?最近相关的求助不少呀

好像是吧,可是小木虫里面还有系统地整理这一块内容,希望版主能够为广大虫友们谋福利啊
4楼2015-04-23 14:02:25
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