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Y224365

木虫 (小有名气)

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[求助] 求助使用lammps进行粗粒化模拟的要点已有1人参与

刚接触lammps不久，课题需要用lammps进行粗粒化模拟，自己看了mannual很久，对pair_style以及力场的设置不是很了解，想麻烦有了解的虫友能够提供一些指导，也可以交流，如果能有一些资源提供就更好了，不胜感激。

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1楼2015-04-23 09:03:01

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

lsloneil

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
Y224365: 金币+20, ★★★很有帮助 2015-04-24 21:36:35

请仔细搜索阅读本版内关于粗粒化的一些回帖，比如这个
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=8450437

粗粒化只是一种力场，粗粒化力场参数的获取大多都是通过其他方式计算和拟合得到的，LAMMPS能做的不是获得力场参数，而是用已知力场参数进行模拟。

粗粒化力场很多，很多都是针对不同的需要的，你应该根据自己体系的需要，选择合适的粗粒化力场。比较有名的，像MARTINI，都是要额外的程序才能获得这些参数的：http://md.chem.rug.nl/cgmartini/index.php/downloads

又如DPD，DPD参数的获得也有它自己的一套方法，一般是通过Flory-Huggins参数来获得，具体怎么获得自己看文献。

又如水分子，有很多文章是拟合粗粒化水分子的力场的。