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求助大神们,PCR引物C端如何加蛋白标签flag?

作者 清若123456
来源: 小木虫 750 15 举报帖子
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急急急,求大神们救救急(。。。。。。。。。。。。。。。。凑字数。。。。。。。。。。。。。。。。。前面的帖子以及删了,怎么这个还提示
对不起,您已经发过类似内容的主题了,请不要一帖多发哦发不了)

老师让我在引物(PCR引物)序列中引入蛋白标签flag,方便后续的纯化。我的蛋白是分泌蛋白,我查到分泌蛋白一般建议把标签插在C端,求问大神们,我这样设计对不对?

上游引物F :CCC(保护碱基)+ AAGCTT (酶切位点)+ KOZAK序列 +引物序列+GATTACAAGGATGACGACGATAAG(标签序列)

下游引物R:GC(保护碱基)+ GTCGAC(酶切位点) +引物序列 +CTTATCGTCGTCATCCTTGTAATC(flag标签序列反向互补)

我之前查的有人说说标签蛋白只需要加在上游引物就行,下游不用加?但那样两个的TM值不就差距很大了吗? 返回小木虫查看更多

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  • 精华评论
  • 清若123456

    引用回帖:
    12楼: Originally posted by snoopyzxx at 2021-04-03 07:57:26
    注意终止密码子的位置。
    ...

    大神,你的意思是下游引物的蛋白标签应该在引物序列之前吗?是这样吗?
    上游引物F :CG(保护碱基)+ AAGCTT (酶切位点)+ KOZAK序列 +引物序列
    下游引物R:CG(保护碱基)+ GTCGAC(酶切位点) +蛋白标签序列 +引物序列

  • 清若123456

    引用回帖:
    11楼: Originally posted by goblin7 at 2021-04-03 07:54:34
    还有你上面的那个问题,我一般用软件设计,如果你人工设计,有一个算是小技巧吧。
    就你就跟上游一样设计下游,然后反向互补送公司合成就行了
    ...

    引物设计我也用的Prime5软件,师姐跟我说设计完把保护碱基酶切位点加上去就行。迷惑的点就是蛋白标签位置应该加在哪里?师姐她之前也没有这个经验。大神,那你这层楼的意思我没大懂。你看可以顺序可以这么来吗?
    上游引物F :CG(保护碱基)+ AAGCTT (酶切位点)+ KOZAK序列 +引物序列
    下游引物R:CG(保护碱基)+ GTCGAC(酶切位点) +蛋白标签序列 +引物序列

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