通常情况下，对于SDS-PAGE胶分离的蛋白样品来说，考马斯和SYPRO Ruby染色的蛋白质条带都能与质谱鉴定很好的兼容。但是对于银染的蛋白质一定不能使用戊二醛作为固定剂，这会影响到接下来的质谱分析。另外，蛋白质干粉和蛋白质也都能够进行样品测序。如果蛋白质溶液的浓度较低，在样品准备过程中则需要尽量减少SDS等表面活性剂的使用，并注意降低盐浓度，这样可以相应提升蛋白质鉴定的精准度，具体可以咨询百泰派克生物科技平台，

有需要可以联系我，我这边可做测序

http://edu.majorbio.com/lesson/678  这个视频介绍的有蛋白测序的要求，老师可以看一下，如果了解详情，可以加我QQ  2362649156