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16SrDNA菌落PCR产物电泳无条带

作者 GFP~
来源: 小木虫 250 5 举报帖子
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我又来了
我用菌落PCR扩增3个菌的16SrDNA条带,之前没有用10微升dd水稀释菌落,结果电泳条带很糊,后来稀释了,结果有一个菌跑出了条带,另外两个没有条带,重复实验时,都没有条带了,求各位大佬帮帮忙分析一下。
只有最后面的条带是我的,前面那个跑出的条带是另一个人的,我们用的试剂和体系都一样,他做了两个菌,只跑出这一个条带,前面的没有条带的6个孔是我新做的,都没有跑出条带,最后一个是我之前做的,跑出一个条带,然后点样孔很亮的是一个菌,也不知道什么原因,感觉它跑不出去

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  • 精华评论
  • snoopytbw

    感觉跑的蛮好的,比我强,说明体系摸索的蛮不错,P不出来就是引物不合适或者酶延伸困难等原因吧,先试试用高保真做一遍吧,说不定就有条带了呢,taq一般不适合扩16s吧。我们现在都是用高保真扩的,taq改良型的应该也行,不过总体感觉不如高保真,

  • 小冀-

    如果菌落pcr出不来的话,你可以试试提一下基因组,会好很多

  • snoopytbw

    对了,问一下,菌落PCR前,你是热裂的么,100度多少分钟啊,需要知道这个,可能裂解不完全呢

  • GFP~

    我没有热裂解,只是挑了单菌落,然后10微升dd水稀释后吸取1微升菌液于PCR体系里,然后做PCR

  • GFP~

    我后来多做了几个平行管,总算有个别出条带了

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