菌种鉴定结果不一致的问题
求大神解答疑问:
同一个细菌，第一次16s方法测序出来是革兰氏阴性菌，甘油管冻存2~3年后第二次用同样方法测序居然是革兰氏阳性芽孢杆菌。
关键我们第二次做是用G-性菌提取基因组的方法，按理是提不出G+性菌的，所以不太像试验污染的问题。
这样情况出现很多次了，都是测序结果由G-性菌变成芽孢，请大神帮忙解惑！
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还能这么神奇？
16s本来就不准确，你看看测序结果，DNA序列比对下，是不是差异不大，多半是你用了通用引物导致的
我也遇到这个情况，明明做的是大肠杆菌，是革兰氏阴性的，对其进行胁迫处理后进行菌种鉴定，结果鉴定结果出来说是革兰氏阳性的芽孢杆菌，不知道怎么回事，请问你后面搞清楚了吗，
提取革兰氏阴性菌基因组的试剂盒完全可以用到革兰氏阳性细菌上，我们曾经用阴性试剂盒提过枯草芽孢杆菌的基因组，也是可以的，之所以测到了，有可能你保存的种子不纯