在文献中看到下图，是利用vasp做第一原理分子动力学（MD）模拟600K下超胞中原子振动轨迹图（trajectory）。请问这张轨迹图具体应该怎样画出呢？
我尝试了用VMD软件读取vasp-MD计算后的XDATCAR文件，但只能看到原子振动的动画（即将每个模拟时间点的原子位置做为一帧），却无将整个模拟时间内的原子运动连接起来进而法获得这种“轨迹”。哪位大神晓得如何获得下图，望不吝赐教！！谢谢啦~~


QQ截图20151231140358.png 返回小木虫查看更多