应该是环境变量没设好吧。
参阅：http://manual.gromacs.org/online/getting_started.html#setup

引用回帖:

2楼: Originally posted by winterz at 2011-08-09 14:11:55:
应该是环境变量没设好吧。
参阅：http://manual.gromacs.org/online/getting_started.html#setup

我查了一下 /usr/local/gromacs-4.5.4/bin 文件夹下有g_luck，如下
node13:/usr/local/gromacs-4.5.4/bin # ls
GMXRC            g_confrms      g_luck       g_rotacf   
...
...
node13:/usr/local/gromacs-4.5.4/bin # g_luck
-bash: g_luck: command not found
但是还是不能执行，...

，

引用回帖:

3楼: Originally posted by lishuxian at 2011-08-09 14:43:38:
我查了一下 /usr/local/gromacs-4.5.4/bin 文件夹下有g_luck，如下
node13:/usr/local/gromacs-4.5.4/bin # ls
GMXRC            g_confrms      g_luck       g_rotacf   
...
...
node13:/usr/local/gro ...

如果你的环境变量中没有当前目录，执行程序是要把路径写上的。

你执行一下：
/usr/local/gromacs-4.5.4/bin/g_luck

引用回帖:

4楼: Originally posted by winterz at 2011-08-09 15:56:30:
如果你的环境变量中没有当前目录，执行程序是要把路径写上的。

你执行一下：
/usr/local/gromacs-4.5.4/bin/g_luck

谢了，可以了。
@node13:~>/usr/local/gromacs-4.5.4/bin/g_luck
gcq#64: "Keep Your Shoes and Socks On, People" (F. Zappa)

但是，我每次要运行都必须加上usr/local/gromacs-4.5.4/bin/[command]才能用，请问有何简便一点的方法，谢过！

把那个路径加入PATH里面。

echo "export PATH=$PATH:/usr/local/gromacs-4.5.4/bin/" >> ~/.bashrc
source ~/.bashrc

建议楼主先熟悉一下linux系统操作

引用回帖:

5楼: Originally posted by lishuxian at 2011-08-09 23:18:24:
谢了，可以了。
@node13:~>/usr/local/gromacs-4.5.4/bin/g_luck
gcq#64: "Keep Your Shoes and Socks On, People" (F. Zappa)

但是，我每次要运行都必须加上usr/local/gromacs-4.5.4/bin/[co ...

现在我又遇到了一个问题，我现在上传不了文件到服务器上了，前几天还可以。我用师兄的账号可以，就我的不行，不知道怎么回事。
我用的是SSH，后来又在自己的机子上装了winSCP，试了一下还是不能上传，说明我的SSH没有问题，所以我想应该是服务器对我的操作权限做了限制，但是我不会改，求教！
不太明白的是，以前怎么没问题，现在怎么又不行了，没有人动服务器呀，郁闷。