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向日21

新虫 (小有名气)

[求助] 要表达蛋白,构建重组质粒,好几次不成功 已有7人参与

要表达蛋白,构建重组质粒,我设计的酶切引物上只有酶切位点6个碱基,无论如何都连不上,是因为与质粒的同源壁太短么?我的片段长两千五百bp。我该怎么设计引物,同源壁要多长?

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xl0071334

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


向日21(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-01-05 19:25:30
楼主的引物没有保护碱基,所以PCR产物没有切开,如果不换引物的话,建议先连T载体

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5楼2016-01-05 07:09:49
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曼陀罗的祈祷

金虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 刘氏响声丸 at 2016-01-05 09:00:52
可能像楼上说的引物设计有点问题
再者就是酶切没有切完全,质粒酶切没有完全
还有就是运气和经验了,,
祝好运

保护碱基必须加的吗
想做个有趣的人,却在逗比的道路上越走越远~
8楼2016-01-05 09:31:06
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qinqqjiajia

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


向日21(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-01-05 19:25:53
可以先连到T载体上然后再转到目的载体上,另外加上保护碱基
9楼2016-01-05 10:46:18
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普通回帖

绿枫隽

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
向日21(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2016-01-05 19:25:04
你的片段不长,应该问题不大,可能原因有几个:第一,酶切位点前一般需要设置保护碱基,第二,你做酶切反应时,没有切开,第三,连接效率不高,第四,你的切好的载体有问题,第五,酶切时时间太长,片段切碎了。供参考

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2楼2015-12-06 10:22:19
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向日21

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 绿枫隽 at 2015-12-06 10:22:19
你的片段不长,应该问题不大,可能原因有几个:第一,酶切位点前一般需要设置保护碱基,第二,你做酶切反应时,没有切开,第三,连接效率不高,第四,你的切好的载体有问题,第五,酶切时时间太长,片段切碎了。供参 ...

我还想再问一下,质粒的浓度要达到多少连接效率会好一点,我之前做的只有10ng/ul

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3楼2015-12-06 10:39:46
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曼陀罗的祈祷

金虫 (正式写手)

西门吹雪170: 应助指数-1, 无应助 2016-01-05 19:25:20
我也是,切好了载体和片段,连了两次都连不上,不知道问题出在哪里
想做个有趣的人,却在逗比的道路上越走越远~
4楼2016-01-04 22:41:51
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chun.shui

金虫 (正式写手)

6楼2016-01-05 07:10:19
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刘氏响声丸

铁虫 (小有名气)


向日21(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2016-01-05 19:26:02
可能像楼上说的引物设计有点问题
再者就是酶切没有切完全,质粒酶切没有完全
还有就是运气和经验了,,
祝好运

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
7楼2016-01-05 09:00:52
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刘氏响声丸

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 曼陀罗的祈祷 at 2016-01-05 09:31:06
保护碱基必须加的吗...

加了保护碱基对切割效率有帮助吧,你可以搜一下各酶切保护碱基的长度和酶切效率

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
10楼2016-01-05 16:52:00
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