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cz4869

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何把测得基因确定到是哪个基因组上的 已有2人参与

现在测得六倍体垂穗披碱草ADH基因的序列,由于是一代测序结果,所以测得的序列包括所有染色体上的。现在我想要把其分开,确定序列到底是来自哪个染色体上。现在对于垂穗披碱草国内外还没有测得其染色体的全基因组。望大神给些意见  实验进行不下去了都。。。
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

要不就看看有没有分子标记,然后做连锁分析。
3楼2015-07-12 07:36:58
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-07-12 23:16:05
没有参考基因组的话,貌似只能做原位杂交。
2楼2015-07-12 07:34:33
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jiqinger

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-07-12 23:16:22
我觉得可以利用滴片的方法制得垂穗披碱草的染色体片子,让后将你克隆的基因做成探针,利用FISH在染色体上定位。
123456
4楼2015-07-12 13:17:45
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cz4869

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by liuderong at 2015-07-12 07:34:33
没有参考基因组的话,貌似只能做原位杂交。

请问能够具体点吗?或者有没有您了解的哪个公司做过这种没有全基因组要定位的?
5楼2015-07-12 13:36:30
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