应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 基因组测序应该选择哪种测序方法？测序前有什么注意事项吗？
91/1返回列表
查看: 1375  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

wq654860

木虫 (初入文坛)

[求助] 基因组测序应该选择哪种测序方法？测序前有什么注意事项吗？ 已有1人参与

本人想克隆某细菌中的一段表达某种酶的未知基因（已通过同源基因设计引物但PCR没有成功），我想通过基因组测序的方法结合保守序列比对找到这段基因，如果测序的话根据测序的要求应该选择哪种测序方法，并且测定基因组时有什么注意事项，希望各位老师给出宝贵意见！谢谢！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2015-03-30 15:43:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lxzk

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wq654860: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-03-31 15:37:54
你这是高射炮打蚊子啊，基因组测序现在很多公司做，用hiseq的平台，价格怎么也得好几千吧，这还是你不用拼接。你最好问一下老师要不要这么做。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下 回复此楼
2楼2015-03-31 09:01:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wq654860

木虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lxzk at 2015-03-31 09:01:47
你这是高射炮打蚊子啊，基因组测序现在很多公司做，用hiseq的平台，价格怎么也得好几千吧，这还是你不用拼接。你最好问一下老师要不要这么做。

我也是刚接触这方面不久，以前通过同源基因设计引物，但没成功，兼并引物还不熟悉，所以才想到基因组测序！基因组测序和通过保守区间比对能达到我想要的目的吗？谢谢！
赞一下 回复此楼
3楼2015-03-31 15:38:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lxzk

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

目的是能达到，我再说一次，这是大工程，不管测序还是数据处理。自己做的话需要生物信息学，听你说还是新手，最好全部外包，测完了会做基因注释，就能看到你要的基因，或者直接用保守区间做blast应该也可以。按你的要求运气不太差的话不需要补gap，时间倒不会太长。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2015-03-31 19:37:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lxzk

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by lxzk at 2015-03-31 19:37:14
目的是能达到，我再说一次，这是大工程，不管测序还是数据处理。自己做的话需要生物信息学，听你说还是新手，最好全部外包，测完了会做基因注释，就能看到你要的基因，或者直接用保守区间做blast应该也可以。按你的 ...

全部外包的话，包括建库，测序和数据处理，价格肯定是以万为单位，具体多少要看你的基因组大小和你选择的公司了。除了hiseq平台，Illumina另外的小规模平台miseq和nextseq也许也可以，取决于基因组大小。Pacific的平台也可以考虑，具体你还是咨询公司。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下 回复此楼
5楼2015-03-31 19:49:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wq654860

木虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by lxzk at 2015-03-31 19:49:50
全部外包的话，包括建库，测序和数据处理，价格肯定是以万为单位，具体多少要看你的基因组大小和你选择的公司了。除了hiseq平台，Illumina另外的小规模平台miseq和nextseq也许也可以，取决于基因组大小。Pacific的 ...

好的  很感谢您的建议！
赞一下 回复此楼
6楼2015-03-31 21:32:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

二十一业

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by lxzk at 2015-03-31 19:49:50
全部外包的话，包括建库，测序和数据处理，价格肯定是以万为单位，具体多少要看你的基因组大小和你选择的公司了。除了hiseq平台，Illumina另外的小规模平台miseq和nextseq也许也可以，取决于基因组大小。Pacific的 ...

小几千块就能做了，亲。
赞一下 回复此楼
7楼2015-04-26 18:31:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

二十一业

铜虫 (小有名气)
你只需要自己提总DNA，然后剩下的交给公司建库测序分析，小几千块就能做了。很多公司都能做，价格周期结果都各有差异。
我用过一个叫泽塔生物的测序，价格不贵，结果出的快，而且很容易读懂，别的公司也接触过，结果给了一堆文件，不好倒腾。
赞一下 回复此楼
8楼2015-04-26 18:36:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wq654860

木虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 二十一业 at 2015-04-26 18:36:34
你只需要自己提总DNA，然后剩下的交给公司建库测序分析，小几千块就能做了。很多公司都能做，价格周期结果都各有差异。
我用过一个叫泽塔生物的测序，价格不贵，结果出的快，而且很容易读懂，别的公司也接触过，结 ...

很感谢您的回答！
回复此楼
9楼2015-04-27 08:04:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 wq654860 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的？ +17 爱看书的可乐 2026-08-26 19/950 2026-08-30 22:24 by xiangy672
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 zICmwzsBXjbN 2026-08-29 5/250 2026-08-30 20:08 by hZiFeudZyoGR
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 4/200 2026-08-30 19:57 by hZiFeudZyoGR
[找工作] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 5/250 2026-08-30 19:48 by hZiFeudZyoGR
[考博] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 5/250 2026-08-30 18:50 by hZiFeudZyoGR
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 5/250 2026-08-30 18:40 by hZiFeudZyoGR
[博后之家] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 4/200 2026-08-30 18:28 by hZiFeudZyoGR
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 9/450 2026-08-30 17:56 by hZiFeudZyoGR
[公派出国] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +7 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-30 17:34 by hZiFeudZyoGR
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 jCd0dEvKHShX 2026-08-29 5/250 2026-08-30 14:03 by GkCVyODlx4mR
[博后之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 8/400 2026-08-30 12:03 by l0VvVHGBGRLv
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 8/400 2026-08-30 12:03 by l0VvVHGBGRLv
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 7/350 2026-08-30 06:10 by ZPa0EcMwuECS
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜？ 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 我不理解！ +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭