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wuxunxun1990

金虫 (正式写手)

[求助] 想做基因测序,不知道是否可以样品混合检测 已有3人参与

为了节省测序经费,是否可以将三批处理的样品混合成一个样,然后测序,这样是不是比只测一个样好
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人生何必久睡,死后定会长眠!
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wuxunxun1990

金虫 (正式写手)

引用回帖:
11楼: Originally posted by 远洋精灵1991 at 2014-09-29 13:49:16
我认为应该分开三次测,然后把测序结果比对

按要求是应该这样做,但是仅测序就要花六七万,我一个硕士,老板怎么可能给这么多钱呢,只能想办法弥补一下嘛
人生何必久睡,死后定会长眠!
12楼2014-09-29 13:54:21
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普通回帖

bwangel

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wuxunxun1990: 金币+3 2014-09-29 09:17:27
你要测什么?混了测的结果不就乱了么
2楼2014-09-29 07:27:41
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jinyanqiu

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wuxunxun1990: 金币+3 2014-09-29 09:17:42
是同样的样品吗?是的话应该可以吧,如果你只要求知道序列,不要求其他的
相信。
3楼2014-09-29 08:52:59
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qapollo

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wuxunxun1990: 金币+3 2014-09-29 09:18:32
你说的是二代测序么?如果是二代测序的话应该没问题。但是你说的如果是一代测序可能就会出现套峰的问题了。
4楼2014-09-29 09:08:28
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wuxunxun1990

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by bwangel at 2014-09-29 07:27:41
你要测什么?混了测的结果不就乱了么

我是想把三次平行试验的样品一起测
人生何必久睡,死后定会长眠!
5楼2014-09-29 09:17:20
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wuxunxun1990

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by jinyanqiu at 2014-09-29 08:52:59
是同样的样品吗?是的话应该可以吧,如果你只要求知道序列,不要求其他的

是平行试验,是要筛差异表达基因
人生何必久睡,死后定会长眠!
6楼2014-09-29 09:18:10
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wuxunxun1990

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by qapollo at 2014-09-29 09:08:28
你说的是二代测序么?如果是二代测序的话应该没问题。但是你说的如果是一代测序可能就会出现套峰的问题了。

最新的测序,找公司做
人生何必久睡,死后定会长眠!
7楼2014-09-29 09:18:49
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bio-li

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-09-29 11:18:39
wuxunxun1990: 金币+1 2014-09-29 11:31:53
不建议混样,如果确实经费有限只能混样,毕竟混样后由于样本间存在的差异导致实验结果的误差
你不能解决问题,你就会成为问题
8楼2014-09-29 10:11:10
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远洋精灵1991

金虫 (小有名气)

头一次听说用这种方式节省经费的,我们测序的时候都是千方百计让样品单一,防止其污染,一个反应大概也就几十块钱,实在不应该这样。你这样怎么确定三次结果是平行的,不是其中一管出问题?
9楼2014-09-29 13:28:33
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wuxunxun1990

金虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 远洋精灵1991 at 2014-09-29 13:28:33
头一次听说用这种方式节省经费的,我们测序的时候都是千方百计让样品单一,防止其污染,一个反应大概也就几十块钱,实在不应该这样。你这样怎么确定三次结果是平行的,不是其中一管出问题?

这一个算起来不太贵,比芯片好多了,我是要三次平行试验,防止某一个样品出现问题才进行的啊
人生何必久睡,死后定会长眠!
10楼2014-09-29 13:43:58
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