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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】国内DNA测序研究概况
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langlang0715

铜虫 (著名写手)

[交流] 【求助/交流】国内DNA测序研究概况

如题，请问各位，目前国内DNA测序有哪些高校或者研究所在做？使用的方法是什么？欢迎大家积极讨论。
我先把我查阅的大概情况说下，我是生物门外汉，不知道理解的对不对，请各位指正。
目前DNA测序技术主要有三代，第一代已经是过去式了，第二代测序技术包括杂交测序和合成测序，比较有代表性的就是454测序仪，目前国内有几大基因研究中心在做这方面的工作，因为毕竟小单位是承受不起这么昂贵的仪器的。再就是第三代测序技术，有代表性的是基因芯片和单分子测序。基因芯片挺热门的，但是不知道有哪些单位在研究这个，单分子测序基本处于起步阶段，目前还有很多问题没得到解决。

我理解的似乎就这点，希望大家积极讨论。
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1楼 2011-02-24 11:21:44
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小白兄

金虫 (小有名气)
langlang0715(金币+2): 谢谢交流 2011-02-24 14:24:48
理解的不错，不过现在主流的测序仪器还是ABI的3730系列，是个生物公司都说能测序！
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2楼2011-02-24 14:18:29
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langlang0715

铜虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by 小白兄 at 2011-02-24 14:18:29:
理解的不错，不过现在主流的测序仪器还是ABI的3730系列，是个生物公司都说能测序！

也不知道测序的准确度怎样
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3楼2011-02-24 14:26:40
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小白兄

金虫 (小有名气)
langlang0715(金币+2): 不测什么，就是了解一下情况呵呵。有没有高校和研究院所的相关信息啊，哪些大牛在做测序？ 2011-02-24 15:08:13
引用回帖:
Originally posted by langlang0715 at 2011-02-24 14:26:40:
也不知道测序的准确度怎样

你是测什么？真核还是原核？目前的测序公司一般针对的是质粒类样品，是通过PCR的sanger测序法，一般一个反应能保证600-800bp的正确，如果你基因较长，可以采用步移延伸的方式继续往上下游测序！
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4楼2011-02-24 15:02:12
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小白兄

金虫 (小有名气)
★
1949stone(金币+1): 关注 2011-02-24 17:51:19
这就没了解过了，我们只把测序当手段，还没研究到那一步。华大基因应该还行吧，
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5楼2011-02-24 16:04:02
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yingyangyang

木虫 (正式写手)
★ ★
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西瓜: 金币+1, 鼓励交流 2012-06-08 23:02:44
测序现在挺火的，上海伯豪公司在测序和芯片方便做的都可以！  测序的仪器挺贵的，一般的公司或者个人是承受不起的！  二代测序主流还是SOLiD 和HiSeq。分别是ABI和ILLUMINA公司的，各有特点和专长的方向。不知道想测的什么。 近几年，RNA转录组的测序分析很火，基因组等等！  就看你需求是什么了！
还有伯豪公司的芯片也是很多，在国内做的市场最大。  
也有人是将芯片和测序联合一起使用，来做实验的！  主要看你需求了！
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6楼2012-06-08 16:18:43
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yingyangyang

木虫 (正式写手)
三代测序，已经出来了吧！ 想要普及推广还是需要些时间啊！ 但是现在二代测序还是主流
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7楼2012-06-08 16:20:08
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beautybanana

木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
现在已有纳米孔的高通量测序技术
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8楼2012-06-08 19:54:42
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yingyangyang

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
1612249楼: Originally posted by beautybanana at 2012-06-08 19:54:42
现在已有纳米孔的高通量测序技术

这个当时就听说了下，不知道现在具体怎么样了呢？？哪里在研发？研发出来么？？ 有详细点的资料可以分享下么？
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9楼2012-06-11 12:06:31
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黑罕

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
送鲜花一朵
2011年03月，Life Technologies中国市场部获悉，Ion Torrent 个人化操作基因组测序仪（Personal Genome Machine简称PGM）正式在中国开始发售。
2012年4月，美国Pacific Biosciences 公司正式发售第三代测序系统—PacBio RS。
在我们伟大的党领导下的科研队伍在2013年一定能推出国产自主品牌的三代测序系统。我们要相信党相信人民的力量。呵呵呵
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10楼2012-07-06 16:14:39
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想飞的fish

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
现有的第三代测序平台主要有：Helicosbiosciences公司的ｔＳＭＳＴＭ（truesinglemolecular sequencing）技术平台，美国Pacific Bioscies公司的SMRT技术（single molecule real time）技术平台；美国Life Technologies
公司的基于FRET测序技术和美国Ion Torrent公司、英国OxfordNanoporeNechologies公司的纳米孔单分子技术。目前进行商业化的只有PacBio公司的PacBio RS II平台，中国目前引进4-5台，已经开始运行。
PacBio公司的PacBio RS II平台由于具有读长长的特点，在基因组测序中能降低测序后的Contig数量，明显减少后续的基因组拼接和注释的工作量，节省大量的时间，细菌完成图测序最快2周内完成测序和生物信息学分析。
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11楼2013-12-26 20:59:59
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