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【求助/交流】国内DNA测序研究概况
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langlang0715
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[交流]
【求助/交流】国内DNA测序研究概况
如题,请问各位,目前国内DNA测序有哪些高校或者研究所在做?使用的方法是什么?欢迎大家积极讨论。
我先把我查阅的大概情况说下,我是生物门外汉,不知道理解的对不对,请各位指正。
目前DNA测序技术主要有三代,第一代已经是过去式了,第二代测序技术包括杂交测序和合成测序,比较有代表性的就是454测序仪,目前国内有几大基因研究中心在做这方面的工作,因为毕竟小单位是承受不起这么昂贵的仪器的。再就是第三代测序技术,有代表性的是基因芯片和单分子测序。基因芯片挺热门的,但是不知道有哪些单位在研究这个,单分子测序基本处于起步阶段,目前还有很多问题没得到解决。
我理解的似乎就这点,希望大家积极讨论。
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2011-02-24 11:21:44
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
现有的第三代测序平台主要有:Helicosbiosciences公司的tSMSTM(truesinglemolecular sequencing)技术平台,美国Pacific Bioscies公司的SMRT技术(single molecule real time)技术平台;美国Life Technologies
公司的基于FRET测序技术和美国Ion Torrent公司、英国OxfordNanoporeNechologies公司的纳米孔单分子技术。目前进行商业化的只有PacBio公司的PacBio RS II平台,中国目前引进4-5台,已经开始运行。
PacBio公司的PacBio RS II平台由于具有读长长的特点,在基因组测序中能降低测序后的Contig数量,明显减少后续的基因组拼接和注释的工作量,节省大量的时间,细菌完成图测序最快2周内完成测序和生物信息学分析。
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11楼
2013-12-26 20:59:59
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langlang0715(金币+2): 谢谢交流 2011-02-24 14:24:48
理解的不错,不过现在主流的测序仪器还是ABI的3730系列,是个生物公司都说能测序!
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2楼
2011-02-24 14:18:29
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langlang0715
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引用回帖:
Originally posted by
小白兄
at 2011-02-24 14:18:29:
理解的不错,不过现在主流的测序仪器还是ABI的3730系列,是个生物公司都说能测序!
也不知道测序的准确度怎样
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3楼
2011-02-24 14:26:40
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langlang0715(金币+2): 不测什么,就是了解一下情况呵呵。有没有高校和研究院所的相关信息啊,哪些大牛在做测序? 2011-02-24 15:08:13
引用回帖:
Originally posted by
langlang0715
at 2011-02-24 14:26:40:
也不知道测序的准确度怎样
你是测什么?真核还是原核?目前的测序公司一般针对的是质粒类样品,是通过PCR的sanger测序法,一般一个反应能保证600-800bp的正确,如果你基因较长,可以采用步移延伸的方式继续往上下游测序!
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4楼
2011-02-24 15:02:12
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