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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】怎样确定一个基因在基因组中是不是单拷贝
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怎么都行

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】怎样确定一个基因在基因组中是不是单拷贝

我们所研究的的一种作物的某个基因，之前的报道一直认为是单拷贝基因，但现在某些迹象让人生疑。怎样确定这个基因在基因组中是不是单拷贝基因呢？
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1楼 2010-12-07 01:24:26
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boouy

银虫 (正式写手)
怎么都行(金币+1): 2010-12-07 22:53:06
引用回帖:
Originally posted by 怎么都行 at 2010-12-07 01:24:26:
我们所研究的的一种作物的某个基因，之前的报道一直认为是单拷贝基因，但现在某些迹象让人生疑。怎样确定这个基因在基因组中是不是单拷贝基因呢？

若干种酶切后做southern blot.
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2楼2010-12-07 07:31:09
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holyala

木虫 (著名写手)
怎么都行(金币+1):用什么做内参比对啊？ 2010-12-07 22:52:51
做个QPCR都可以了啊。
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3楼2010-12-07 09:30:01
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lwh_xp

木虫 (初入文坛)
怎么都行(金币+1): 2010-12-07 22:52:00
PCR 挑克隆测序，呵呵~~好像也可以哈
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4楼2010-12-07 10:27:10
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srlee

铁杆木虫 (小有名气)
怎么都行(金币+1): 2010-12-07 22:51:51
引用回帖:
Originally posted by 怎么都行 at 2010-12-07 01:24:26:
我们所研究的的一种作物的某个基因，之前的报道一直认为是单拷贝基因，但现在某些迹象让人生疑。怎样确定这个基因在基因组中是不是单拷贝基因呢？

1）同2楼，酶切后southern bloting；2）设计兼并引物PCR测序看看；3）更牛的是全基因组测序啦！祝实验顺利！
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5楼2010-12-07 11:44:21
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shaquila

金虫 (正式写手)
怎么都行(金币+1): 2010-12-07 22:51:02
同楼上，单切后southern杂交，可以用不同酶，不同探针做个重复，这个应该是目前最经典的方法
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6楼2010-12-07 13:29:47
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