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16S序列相似性比对
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枯草芽孢杆君
铜虫
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16S序列相似性比对
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想知道两个菌16s序列之间的相似性,就像下图所示的那样,需要使用什么软件啊?请大神告知。
6.png
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韩仁灿
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【答案】应助回帖
感谢参与,应助指数 +1
Ncbi 网站中的 blast
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6楼
2015-07-01 16:22:06
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hkqgeoffrey
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专业: 病毒学
【答案】应助回帖
感谢参与,应助指数 +1
这个应该是通过本地blast得到的,这样还挺复杂 不如直接在线blast得到表式数据,也可以读出这些信息
[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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兴趣是第一导师,我爱它,因此我毫无疲倦的探索
2楼
2015-06-30 07:42:13
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枯草芽孢杆君
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专业: 微生物资源与分类学
引用回帖:
2楼
:
Originally posted by
hkqgeoffrey
at 2015-06-30 07:42:13
这个应该是通过本地blast得到的,这样还挺复杂 不如直接在线blast得到表式数据,也可以读出这些信息
在线blast是用哪个网站?本地blast的话有什么软件可以推荐吗?先谢啦
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3楼
2015-06-30 12:47:50
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greensummer
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3楼
:
Originally posted by
枯草芽孢杆君
at 2015-06-30 12:47:50
在线blast是用哪个网站?本地blast的话有什么软件可以推荐吗?先谢啦...
可以去NCBI去比对
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4楼
2015-06-30 21:10:18
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