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myapple1989

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[求助] 新种鉴定时参考菌株的选择

在放线菌新种鉴定时需要选择参考菌株做多项分类研究，问题是这个参考菌株一般选择几株比较合适，是选择比对时相似度比较高的菌株做参考菌株，还是选择建系统发育树时聚到一起的，我查看了好多论文，不同的人选择的情况都不一样，还望大神给予解答，谢谢！！

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1楼2013-10-25 16:01:20

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niyq

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【答案】应助回帖

★ ★
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laozuzunzhe: 金币+2, 鼓励应助！ 2013-10-29 20:36:27

相似度比较高的菌株，你指的啥相似，生理的还是16
s的，序列月相似的在进化树上应该汇聚在一起，总体上生理数据和分子数据应该会有一致性，所以选同一个属相近种的菌株，你要是不确定那就越多越好

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2楼2013-10-26 16:58:55

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myapple1989

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2楼: Originally posted by niyq at 2013-10-26 16:58:55
相似度比较高的菌株，你指的啥相似，生理的还是16
s的，序列月相似的在进化树上应该汇聚在一起，总体上生理数据和分子数据应该会有一致性，所以选同一个属相近种的菌株，你要是不确定那就越多越好

我指的是16S相似性，比对时相似度高的，建树时没能聚到一块，这种情况下应该怎样选择参考菌株呀

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3楼2013-10-28 19:39:51

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