24小时热门版块排行榜    

查看: 2336  |  回复: 12
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

myapple1989

铁虫 (小有名气)

[求助] 新种鉴定时参考菌株的选择

在放线菌新种鉴定时需要选择参考菌株做多项分类研究,问题是这个参考菌株一般选择几株比较合适,是选择比对时相似度比较高的菌株做参考菌株,还是选择建系统发育树时聚到一起的,我查看了好多论文,不同的人选择的情况都不一样,还望大神给予解答,谢谢!!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Miss_33310

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by myapple1989 at 2013-10-28 19:39:51
我指的是16S相似性,比对时相似度高的,建树时没能聚到一块,这种情况下应该怎样选择参考菌株呀...

这个应该不常出现吧 是不是画树的时候操作有误了?
5楼2013-10-30 09:08:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

niyq

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
laozuzunzhe: 金币+2, 鼓励应助! 2013-10-29 20:36:27
相似度比较高的菌株,你指的啥相似,生理的还是16
s的,序列月相似的在进化树上应该汇聚在一起,总体上生理数据和分子数据应该会有一致性,所以选同一个属相近种的菌株,你要是不确定那就越多越好
2楼2013-10-26 16:58:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

myapple1989

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by niyq at 2013-10-26 16:58:55
相似度比较高的菌株,你指的啥相似,生理的还是16
s的,序列月相似的在进化树上应该汇聚在一起,总体上生理数据和分子数据应该会有一致性,所以选同一个属相近种的菌株,你要是不确定那就越多越好

我指的是16S相似性,比对时相似度高的,建树时没能聚到一块,这种情况下应该怎样选择参考菌株呀
3楼2013-10-28 19:39:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

niyq

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


zhang8826857: 金币+1, 鼓励交流 2013-10-29 23:13:31
我认为你的进化树间的也有点问题,你想想假如100的相似,你认为进化树树上会有不在一起的可能吗,把比对后的空位去除,再试试看结果
4楼2013-10-29 15:09:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +11 angus9576 2026-08-25 11/550 2026-08-25 17:08 by ZJTJZ
[基金申请] 有没有大神帮我看看基金代码 28+3 1234567wang 2026-08-24 9/450 2026-08-25 16:51 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +20 羊腰板 2026-08-21 23/1150 2026-08-25 16:34 by zsna
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 +6 ziyangfang 2026-08-25 8/400 2026-08-25 16:28 by 宝贝的猪
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 22/1100 2026-08-25 15:36 by 医学老男孩
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +5 process2012 2026-08-23 7/350 2026-08-25 09:42 by huixian257
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +17 kkkl_v 2026-08-19 18/900 2026-08-25 09:41 by windflowerwy
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[基金申请] 明天应该可查了!? +5 chengyan1220 2026-08-23 5/250 2026-08-24 23:28 by 我4大白菜
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +14 ziyangfang 2026-08-19 17/850 2026-08-24 18:37 by 哈哈蛤?
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
请填处理意见