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16S序列相似性比对
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枯草芽孢杆君
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16S序列相似性比对
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想知道两个菌16s序列之间的相似性,就像下图所示的那样,需要使用什么软件啊?请大神告知。
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2015-06-29 23:51:41
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hkqgeoffrey
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这个应该是通过本地blast得到的,这样还挺复杂 不如直接在线blast得到表式数据,也可以读出这些信息
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2楼
:
Originally posted by
hkqgeoffrey
at 2015-06-30 07:42:13
这个应该是通过本地blast得到的,这样还挺复杂 不如直接在线blast得到表式数据,也可以读出这些信息
在线blast是用哪个网站?本地blast的话有什么软件可以推荐吗?先谢啦
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2015-06-30 12:47:50
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Originally posted by
枯草芽孢杆君
at 2015-06-30 12:47:50
在线blast是用哪个网站?本地blast的话有什么软件可以推荐吗?先谢啦...
可以去NCBI去比对
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2015-06-30 21:10:18
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hkqgeoffrey
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很有帮助
2015-07-01 16:50:59
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3楼
:
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枯草芽孢杆君
at 2015-06-30 12:47:50
在线blast是用哪个网站?本地blast的话有什么软件可以推荐吗?先谢啦...
对的ncbi 本地技术参考《DNA与蛋白质分析工具》 薛庆忠编写的
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5楼
2015-07-01 09:06:16
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韩仁灿
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Ncbi 网站中的 blast
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爱睡猪
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这个图片可以用Bioedit得到
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ControlMyself
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2015-07-02 08:32:24
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zqp9110
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MEGA5也能给出多条序列的相似性(差异度)。
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BEYOND
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2015-07-03 11:25:39
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haloarchaeon
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可以试试这个网站http://fasta.bioch.virginia.edu/fasta_www2/fasta_www.cgi
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haloarchaeon
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2015-07-04 17:40:47
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