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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 16S序列相似性比对
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枯草芽孢杆君

铜虫 (初入文坛)

[求助] 16S序列相似性比对 已有5人参与

想知道两个菌16s序列之间的相似性，就像下图所示的那样，需要使用什么软件啊？请大神告知。

16S序列相似性比对
6.png
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1楼 2015-06-29 23:51:41
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hkqgeoffrey

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
这个应该是通过本地blast得到的，这样还挺复杂   不如直接在线blast得到表式数据，也可以读出这些信息

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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兴趣是第一导师，我爱它，因此我毫无疲倦的探索
2楼2015-06-30 07:42:13
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枯草芽孢杆君

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hkqgeoffrey at 2015-06-30 07:42:13
这个应该是通过本地blast得到的，这样还挺复杂   不如直接在线blast得到表式数据，也可以读出这些信息

在线blast是用哪个网站？本地blast的话有什么软件可以推荐吗？先谢啦
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3楼2015-06-30 12:47:50
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greensummer

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 枯草芽孢杆君 at 2015-06-30 12:47:50
在线blast是用哪个网站？本地blast的话有什么软件可以推荐吗？先谢啦...

可以去NCBI去比对
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4楼2015-06-30 21:10:18
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hkqgeoffrey

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
枯草芽孢杆君: 金币+3, ★★★很有帮助 2015-07-01 16:50:59
引用回帖:
3楼: Originally posted by 枯草芽孢杆君 at 2015-06-30 12:47:50
在线blast是用哪个网站？本地blast的话有什么软件可以推荐吗？先谢啦...

对的ncbi     本地技术参考《DNA与蛋白质分析工具》 薛庆忠编写的

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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兴趣是第一导师，我爱它，因此我毫无疲倦的探索
5楼2015-07-01 09:06:16
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韩仁灿

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
Ncbi   网站中的  blast

[ 发自小木虫客户端 ]
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6楼2015-07-01 16:22:06
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爱睡猪

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
这个图片可以用Bioedit得到
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ControlMyself
7楼2015-07-02 08:32:24
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zqp9110

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

MEGA5也能给出多条序列的相似性（差异度）。
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BEYOND
8楼2015-07-03 11:25:39
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haloarchaeon

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

可以试试这个网站http://fasta.bioch.virginia.edu/fasta_www2/fasta_www.cgi
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haloarchaeon
9楼2015-07-04 17:40:47
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