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枯草芽孢杆君

铜虫 (初入文坛)

[求助] 16S序列相似性比对 已有5人参与

想知道两个菌16s序列之间的相似性,就像下图所示的那样,需要使用什么软件啊?请大神告知。

16S序列相似性比对
6.png
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hkqgeoffrey

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这个应该是通过本地blast得到的,这样还挺复杂   不如直接在线blast得到表式数据,也可以读出这些信息

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
兴趣是第一导师,我爱它,因此我毫无疲倦的探索
2楼2015-06-30 07:42:13
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枯草芽孢杆君

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by hkqgeoffrey at 2015-06-30 07:42:13
这个应该是通过本地blast得到的,这样还挺复杂   不如直接在线blast得到表式数据,也可以读出这些信息

在线blast是用哪个网站?本地blast的话有什么软件可以推荐吗?先谢啦
3楼2015-06-30 12:47:50
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greensummer

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 枯草芽孢杆君 at 2015-06-30 12:47:50
在线blast是用哪个网站?本地blast的话有什么软件可以推荐吗?先谢啦...

可以去NCBI去比对
4楼2015-06-30 21:10:18
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hkqgeoffrey

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
枯草芽孢杆君: 金币+3, ★★★很有帮助 2015-07-01 16:50:59
引用回帖:
3楼: Originally posted by 枯草芽孢杆君 at 2015-06-30 12:47:50
在线blast是用哪个网站?本地blast的话有什么软件可以推荐吗?先谢啦...

对的ncbi     本地技术参考《DNA与蛋白质分析工具》 薛庆忠编写的

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
兴趣是第一导师,我爱它,因此我毫无疲倦的探索
5楼2015-07-01 09:06:16
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韩仁灿

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
Ncbi   网站中的  blast

[ 发自小木虫客户端 ]
6楼2015-07-01 16:22:06
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爱睡猪

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这个图片可以用Bioedit得到
ControlMyself
7楼2015-07-02 08:32:24
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zqp9110

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

MEGA5也能给出多条序列的相似性(差异度)。
BEYOND
8楼2015-07-03 11:25:39
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haloarchaeon

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

可以试试这个网站http://fasta.bioch.virginia.edu/fasta_www2/fasta_www.cgi
haloarchaeon
9楼2015-07-04 17:40:47
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