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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 核酸杂交 » 小RNA分子鉴定（检测）
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虫虫欲动

金虫 (小有名气)

[求助] 小RNA分子鉴定（检测） 已有1人参与

我实验中设计一个19nt 小RNA分子的鉴定，请大家指导比较方便的检测方法。
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1楼 2015-06-01 14:34:01
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晞朔

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
楼主这个问题很难回答。一个19nt的小RNA是一个novel miRNA吗？如果是，鉴定一个新的miRNA需要很多证据，其前体是否存在茎环结构。

另外，19 nt被称为小RNA有点牵强，楼主确定其有小RNA功能吗？一般microRNA在21-25 nt，siRNA在21-23 nt，piRNA一般在25-30nt。
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2楼2015-06-01 15:00:09
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虫虫欲动

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 晞朔 at 2015-06-01 15:00:09
楼主这个问题很难回答。一个19nt的小RNA是一个novel miRNA吗？如果是，鉴定一个新的miRNA需要很多证据，其前体是否存在茎环结构。

另外，19 nt被称为小RNA有点牵强，楼主确定其有小RNA功能吗？一般microRNA在21- ...

我没说清楚，其实这个RNA是已知的，就是研究它与某个蛋白的相互作用，需要看他们能否结合，结合后要通过检测RNA来确定，所以需要检测
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3楼2015-06-01 15:05:57
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晞朔

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 虫虫欲动 at 2015-06-01 15:05:57
我没说清楚，其实这个RNA是已知的，就是研究它与某个蛋白的相互作用，需要看他们能否结合，结合后要通过检测RNA来确定，所以需要检测...

你用的是什么系统？做的互作，应该都有配套的检测系统
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4楼2015-06-01 15:10:18
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虫虫欲动

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 晞朔 at 2015-06-01 15:10:18
你用的是什么系统？做的互作，应该都有配套的检测系统...

用RIP，让用γ-32PATP标记RNA分子的5'末端，但觉得这种操作比较复杂。
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5楼2015-06-01 15:14:46
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晞朔

金虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 虫虫欲动 at 2015-06-01 15:14:46
用RIP，让用γ-32PATP标记RNA分子的5'末端，但觉得这种操作比较复杂。...

其他的，也没想到用什么检测。看其他虫子如何解答吧。
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6楼2015-06-01 15:17:59
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