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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 求教引物设计
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柳弯儿

新虫 (正式写手)

[求助] 求教引物设计已有1人参与

菜鸟一个、看过文献、也看过步骤、一头雾水。专业也不是干这个的。希望大神们能教我如何设计引物、软件的问题我都能解决、网上也有步骤。我不知道怎么去查找序列……例如、我要做FTO基因、然后呢？我真的啥也不会  求大神指导！

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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1楼2015-05-29 23:55:15
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 柳弯儿 at 2015-05-30 15:10:48
就做普通pcr  酶切  电泳  看目的基因是否表达。  我如果按照fto找   会出现很多序列   我想问  是不是应该按照 我要做的位点去ncbi查序列  然后再将序列复制在软件里设计引物   是不是呢？  我是不理解这个怎么去 ...

看目的基因是否表达，并不是普通PCR，要用mRNA反转录成cDNA做模板做半定量或实时荧光定量PCR，也用不着酶切。按FTO找，出现很多序列，再从里面找你做的物种的。你要做的位点是什么意思？
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4楼2015-05-30 18:27:21
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
晞朔: 金币+1 2015-05-30 13:51:31
网上有很多关于如何使用NCBI查找序列的资料，如果知道FTO基因登录号，就用登录号查，如果不知道就用基因名称查。另外你设计引物是要做什么实验？不同实验引物要求不同。
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2楼2015-05-30 10:11:14
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柳弯儿

新虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2015-05-30 10:11:14
网上有很多关于如何使用NCBI查找序列的资料，如果知道FTO基因登录号，就用登录号查，如果不知道就用基因名称查。另外你设计引物是要做什么实验？不同实验引物要求不同。

就做普通pcr  酶切  电泳  看目的基因是否表达。  我如果按照fto找   会出现很多序列   我想问  是不是应该按照 我要做的位点去ncbi查序列  然后再将序列复制在软件里设计引物   是不是呢？  我是不理解这个怎么去找。

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3楼2015-05-30 15:10:48
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柳弯儿

新虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by stone2239 at 2015-05-30 18:27:21
看目的基因是否表达，并不是普通PCR，要用mRNA反转录成cDNA做模板做半定量或实时荧光定量PCR，也用不着酶切。按FTO找，出现很多序列，再从里面找你做的物种的。你要做的位点是什么意思？...

人血提的DNA  我们老师说不用定量、荧光什么的  就普通pcr   位点的话  我查文章 fto的有诸如rs285566这样的位点   我查来查去也是一头雾水   我想知道怎么去查序列

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5楼2015-05-30 23:02:54
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